anaeróbne mikróby. Aeróbne a anaeróbne baktérie

• 1. Genetické a biochemické mechanizmy liekovej rezistencie. Spôsob, ako prekonať rezistenciu baktérií na lieky.
• 2. Pochopenie „infekcie“, „infekčného procesu“, „infekčného ochorenia“. Podmienky pre vznik infekčnej choroby.
• 1. Racionálna antibiotická terapia. Vedľajšie účinky antibiotík na ľudský organizmus a mikroorganizmy. Tvorba foriem baktérií rezistentných a závislých na antibiotikách.
• 2. Zrážková reakcia a jej odrody. Mechanizmus a metódy tuhnutia, praktická aplikácia.
• 1. Metódy stanovenia citlivosti baktérií na antibiotiká. Stanovenie koncentrácie antibiotík v moči, krvi.
• 2. Hlavné bunky imunitného systému: t, b-lymfocyty, makrofágy, subpopulácie t-buniek, ich vlastnosti a funkcie.
• 1. Mechanizmy účinku antibiotík na mikrobiálnu bunku. Baktericídny účinok a bakteriostatický účinok antibiotík. Jednotky merania antimikrobiálnej aktivity antibiotika.
• 2. Reakcia imunitnej lýzy ako jeden z mechanizmov ničenia mikróbov, zložky reakcie, praktické využitie.
• 3. Pôvodca syfilisu, taxonómia, charakteristika biologických vlastností, faktory patogenity. Epidemológia a patogenéza. Mikrobiologická diagnostika.
• 1. Spôsoby kultivácie bakteriofágov, ich titrácia (podľa Grazia a Appelmana).
• 2. Bunková spolupráca medzi t, b-lymfocytmi a makrofágmi v procese humorálnej a bunkovej imunitnej odpovede.
• 1.Dýchanie baktérií. Aeróbne a anaeróbne typy biologickej oxidácie. Aeróby, anaeróby, fakultatívne anaeróby, mikroaerofily.
• 1. Pôsobenie biologických faktorov na mikroorganizmy. Antagonizmus v mikrobiálnych biocenózach, bakteriocíny.
• 3. Bordetella. Taxonómia, charakterizácia biologických vlastností, faktory patogenity. Choroby spôsobené Bordetellou. patogenéza čierneho kašľa. Laboratórna diagnostika, špecifická profylaxia.
• 1. Pojem baktérie. Autotrofy a heterotrofy. Holofytický spôsob výživy baktérií. Mechanizmy prenosu živín v bakteriálnej bunke.
• 2. Antigénna štruktúra bakteriálnej bunky. Hlavnými vlastnosťami mikrobiálnych antigénov sú lokalizácia, chemické zloženie a špecifickosť antigénov baktérií, toxínov, enzýmov.
• 1. Antibiotiká. História objavov. Klasifikácia antibiotík podľa spôsobov prípravy, pôvodu, chemickej štruktúry, mechanizmu účinku, spektra antimikrobiálnej aktivity.
• 3. Vírusy chrípky, taxonómia, všeobecná charakteristika, antigény, typy variability. Epidemiológia a patogenéza chrípky, laboratórna diagnostika. Špecifická profylaxia a liečba chrípky.
• 2. Sérologická metóda diagnostiky infekčných ochorení, jej vyhodnotenie.
• 3. Diarrheogénne escherichie, ich odrody, faktory patogenity, nimi spôsobené choroby, laboratórna diagnostika.
• 1. Všeobecná charakteristika húb, ich klasifikácia. úlohu v ľudskej patológii. Aplikované aspekty štúdie.
• 3. Escherichia, ich úloha ako normálneho obyvateľa čreva. Hygienické indikatívne hodnoty Escherichia pre vodu a pôdu. Escherichia ako etiologický faktor purulentno-zápalových ochorení u ľudí.
• 1. Využitie bakteriofágov v mikrobiológii a medicíne na diagnostiku, prevenciu a liečbu infekčných chorôb.
• 2. Toxíny Baktérie: endotoxín a exotoxíny. Klasifikácia exotoxínov, chemické zloženie, vlastnosti, mechanizmus účinku. Rozdiely medzi endotoxínmi a exotoxínmi.
• 3. Mykoplazmy, taxonómia, druhy patogénne pre človeka. Charakterizácia ich biologických vlastností, faktory patogenity. patogenéza a imunita. Laboratórna diagnostika. Prevencia a terapia.
• 1. Laboratórna diagnostika dysbiózy. Lieky používané na prevenciu a liečbu dysbakteriózy.
• 2. Imunofluorescencia v diagnostike infekčných ochorení. Priame a nepriame metódy. Požadované lieky.
• 3. Vírus kliešťovej encefalitídy, taxonómia, všeobecná charakteristika. Epidemiológia a patogenéza, laboratórna diagnostika, špecifická prevencia kliešťovej encefalitídy.
• 1. Vlastnosti štruktúry rickettsie, mykoplazmy a chlamýdií. Spôsoby ich pestovania.
• 2. Biologické produkty používané na špecifickú prevenciu a liečbu infekčných chorôb: vakcíny.
• 3. Salmonella, taxonómia. Pôvodca týfusu a paratýfu. Epidemiológia patogenézy brušného týfusu. Laboratórna diagnostika. špecifická profylaxia.
• 2. Antigénna štruktúra toxínov, vírusov, enzýmov: ich lokalizácia, chemické zloženie a špecifickosť. Anatoxíny.
• 3. Vírusy – pôvodcovia akútnych respiračných ochorení. Paramyxovírusy, všeobecná charakteristika čeľade, spôsobené choroby. Patogenéza osýpok, špecifická prevencia.
• 1. Rozmnožovanie vírusov (disjunktívna reprodukcia). Hlavné štádiá interakcie vírusu s hostiteľskou bunkou v produktívnom type infekcie. Vlastnosti reprodukcie vírusov obsahujúcich DNA a RNA.
• 2. Pojem ranové, respiračné, črevné, krvné a urogenitálne infekcie. Antroponózy a zoonózy. Mechanizmy prenosu infekcie.
• 3. Clostridium tetanus, taxonómia, charakteristika biologických vlastností, faktory patogenity. Epidemiológia a patogenéza tetanu. Laboratórna diagnostika, špecifická terapia a prevencia.
• 1. Mikroflóra kože, ústnej dutiny zdravého človeka. Mikroflóra slizníc dýchacích ciest, urogenitálneho traktu a očí. Ich zmysel v živote.
• 2. Vnútromaternicové infekcie. Etiológia, spôsoby prenosu infekcie na plod. Laboratórna diagnostika, preventívne opatrenia.
• 1. Typy interakcie vírusov s bunkou: integračné a autonómne.
• 2. Systém komplementu, klasický a alternatívny spôsob aktivácie komplementu. Metódy stanovenia komplementu v krvnom sére.
• 3. Potravinová bakteriálna intoxikácia stafylokokovej povahy. Patogenéza, znaky laboratórnej diagnostiky.
• 1. Pôsobenie chemických faktorov na mikroorganizmy. Aseptika a dezinfekcia. Mechanizmus účinku rôznych skupín antiseptík.
• 2. Vakcíny živé zabité, chemické, toxoidy, syntetické, moderné. Princípy získavania, mechanizmy vytvorenej imunity. adjuvans vo vakcínach.
• 3. Klebsiela, taxonómia, charakteristika biologických vlastností, faktory patogenity, úloha v patológii človeka. Laboratórna diagnostika.
• 1. Dysbakterióza, príčiny, faktory jej vzniku. štádia dysbakteriózy. Laboratórna diagnostika, špecifická prevencia a terapia.
• 2. Úloha neutralizácie toxínu toxoidom. Praktické využitie.
• 3. Pikornovírusy, klasifikácia, charakteristika vírusov poliomyelitídy. Epidemiológia a patogenéza, imunita. Laboratórna diagnostika, špecifická profylaxia.
• 1. Typy variability baktérií: modifikácia a genotypová variabilita. Mutácie, typy mutácií, mechanizmy mutácií, mutagény.
• 2. Lokálna protiinfekčná imunita. Úloha sekrečných protilátok.
• 3. Potravinové bakteriálne toxické infekcie spôsobené Eschirichia, Proteus, Staphylococcus, anaeróbne baktérie. Patogenéza, laboratórna diagnostika.
• 2. Centrálne a periférne orgány imunitného systému. Vekové vlastnosti imunitného systému.
• 1. Cytoplazmatická membrána baktérií, jej štruktúra, funkcie.
• 2. Nešpecifické faktory antivírusovej imunity: antivírusové inhibítory, interferóny (druhy, mechanizmus účinku).
• 1. Protoplasty, sféroplasty, l-formy baktérií.
• 2. Bunková imunitná odpoveď v protiinfekčnej obrane. Interakcia medzi t-lymfocytmi a makrofágmi počas imunitnej odpovede. Spôsoby, ako to zistiť. Alergická diagnostická metóda.
• 3. Hepatitída a vírus, taxonómia, charakterizácia biologických vlastností. Epidemiológia a patogenéza Botkinovej choroby. Laboratórna diagnostika. špecifická profylaxia.
• 2. Protilátky, hlavné triedy imunoglobulínov, ich štruktúrne a funkčné vlastnosti. Ochranná úloha protilátok v protiinfekčnej imunite.
• 3. Vírusy hepatitídy C a E, taxonómia, charakterizácia biologických vlastností. Epidemiológia a patogenéza, laboratórna diagnostika.
• 1. Výtrusy, tobolky, klky, bičíky. Ich štruktúra, chemické zloženie, funkcie, metódy detekcie.
• 2. Kompletné a neúplné protilátky, autoprotilátky. Koncept monoklonálnych protilátok, hybridóm.
• 1. Morfológia baktérií. Základné formy baktérií. Štruktúra a chemické zloženie rôznych štruktúr bakteriálnej bunky: nukleotid, mezozómy, ribozómy, cytoplazmatické inklúzie, ich funkcie.
• 2. Patogenetické znaky vírusových infekcií. Infekčné vlastnosti vírusov. Akútna a pretrvávajúca vírusová infekcia.
• 1. Prokaryoty a eukaryoty, ich rozdiely v štruktúre, chemickom zložení a funkcii.
• 3. Togavírusy, ich klasifikácia. Vírus rubeoly, jeho charakteristika, patogenéza ochorenia u tehotných žien. Laboratórna diagnostika.
• 1. Plazmidy baktérií, typy plazmidov, ich úloha pri určovaní patogénnych znakov a liekovej rezistencie baktérií.
• 2. Dynamika tvorby protilátok, primárna a sekundárna imunitná odpoveď.
• 3. Huby podobné kvasinkám Candida, ich vlastnosti, rozlišovacie znaky, typy húb Candida. úlohu v ľudskej patológii. Podmienky vedúce k výskytu kandidózy. Laboratórna diagnostika.
• 1.Základné princípy systematiky mikroorganizmov. Taxonomické kritériá: kráľovstvo, oddelenie, čeľaď, rodový druh. Pojem kmeň, klon, populácia.
• 2. Pojem imunita. Klasifikácia rôznych foriem imunity.
• 3. Proteus, taxonómia, vlastnosti protea, faktory patogenity. úlohu v ľudskej patológii. Laboratórna diagnostika. Špecifická imunoterapia, fágová terapia.
• 1. Mikroflóra novorodencov, jej tvorba v prvom roku života. Vplyv prsníka a umelého kŕmenia na zloženie mikroflóry dieťaťa.
• 2. Interferóny ako faktory antivírusovej imunity. Typy interferónov, spôsoby získavania interferónov a praktická aplikácia.
• 3. Streptococcus pneumoniae (pneumokok), taxonómia, biologické vlastnosti, faktory patogenity, úloha v patológii človeka. Laboratórna diagnostika.
• 1. Vlastnosti štruktúry aktinomycét, spirochét. Metódy ich detekcie.
• 2. Vlastnosti antivírusovej imunity. Vrodená a získaná imunita. Bunkové a humorálne mechanizmy vrodenej a získanej imunity.
• 3. Enterobaktérie, klasifikácia, všeobecná charakteristika biologických vlastností. Antigénna štruktúra, ekológia.
• 1. Spôsoby kultivácie vírusov: v bunkových kultúrach, kuracích embryách, u zvierat. Ich hodnotenie.
• 2. Aglutinačná reakcia v diagnostike infekcií. Mechanizmy, diagnostická hodnota. Aglutinačné séra (komplexné a monoreceptorové), diagnostika. Záťažové reakcie imunitného systému.
• 3. Campylobacter, taxonómia, všeobecná charakteristika, spôsobené ochorenia, ich patogenéza, epidemiológia, laboratórna diagnostika, prevencia.
• 1. Bakteriologická metóda diagnostiky infekčných chorôb, štádiá.
• 3. Onkogénne DNA vírusy. Všeobecná charakteristika. Virogenetická teória vzniku nádoru L.A. Zilber. Moderná teória karcinogenézy.
• 1. Základné princípy a metódy kultivácie baktérií. Živné pôdy a ich klasifikácia. Kolónie v rôznych typoch baktérií, kultúrne vlastnosti.
• 2. Enzýmová imunoanalýza. Zložky reakcie, varianty jej využitia v laboratórnej diagnostike infekčných ochorení.
• 3. HIV vírusy. História objavov. Všeobecné charakteristiky vírusov. Epidemiológia a patogenéza ochorenia, klinika. Metódy laboratórnej diagnostiky. Problémom je špecifická prevencia.
• 1. Organizácia genetického materiálu bakteriálnej bunky: bakteriálny chromozóm, plazmidy, transpozóny. Genotyp a fenotyp baktérií.
• 2. Reakcia neutralizácie vírusu. Možnosti neutralizácie vírusov, rozsah.
• 3. Yersinia, taxonómia. Charakteristika patogénu moru, faktory patogenity. Epidemiológia a patogenéza moru. Metódy laboratórnej diagnostiky, špecifickej prevencie a terapie.
• 1. Rast a rozmnožovanie baktérií. Fázy reprodukcie bakteriálnych populácií v tekutom živnom médiu za stacionárnych podmienok.
• 2. Séroterapia a séroprofylaxia. Charakterizácia anatotoxických a antimikrobiálnych sér, imunoglobulínov. Ich príprava a titrácia.
• 3. Rotavírusy, klasifikácia, všeobecná charakteristika čeľade. Úloha rotavírusov v črevnej patológii dospelých a detí. Patogenéza, laboratórna diagnostika.
• 2. Reakcia fixácie komplementu v diagnostike infekčných ochorení. Reakčné zložky, praktická aplikácia.
• 3. Vírus hepatitídy b a d, delta vírusy, taxonómia. Všeobecné charakteristiky vírusov. Epidemiológia a patogenéza hepatitídy B atď. Laboratórna diagnostika, špecifická prevencia.
• 1. Genetické rekombinácie: transformácia, transdukcia, konjugácia. Z typov a mechanizmov.
• 2. Spôsoby prenikania mikróbov do organizmu. Kritické dávky mikróbov, ktoré spôsobujú infekčné ochorenie. Vstupná brána infekcie. Spôsoby distribúcie mikróbov a toxínov v tele.
• 3. Vírus besnoty. Taxonómia, všeobecná charakteristika. Epidemiológia a patogenéza vírusu besnoty.
• 1. Mikroflóra ľudského tela. Jeho úloha v normálnych fyziologických procesoch a patológii. Črevná mikroflóra.
• 2. Indikácia mikrobiálnych antigénov v patologickom materiáli pomocou imunologických reakcií.
• 3. Pikornavírusy, taxonómia, všeobecná charakteristika čeľade. Choroby spôsobené vírusmi Coxsackie a Echo. Laboratórna diagnostika.
• 1. Mikroflóra atmosférického vzduchu, obytných priestorov a nemocníc. Sanitárne indikatívne vzdušné mikroorganizmy. Spôsoby vstupu a prežívania mikróbov vo vzduchu.
• 2. Bunkové nešpecifické ochranné faktory: nereaktivita buniek a tkanív, fagocytóza, prirodzení zabijaci.
• 3. Yersinia pseudotuberculosis a enterokolitída, taxonómia, charakteristika biologických vlastností, faktory patogenity. Epidemiológia a patogenéza pseudotrubice
• 1. Vírusy: morfológia a štruktúra vírusov, ich chemické zloženie. Princípy klasifikácie vírusov, význam v humánnej patológii.
• 3. Leptospira, taxonómia, charakteristika biologických vlastností, faktory patogenity. Patogenéza leptospirózy. Laboratórna diagnostika.
• 1. Stredne silné bakteriofágy, ich interakcia s bakteriálnou bunkou. Fenomén lyzogenézy, fágová konverzia, význam týchto javov.

1.Dýchanie baktérií. Aeróbne a anaeróbne typy biologickej oxidácie. Aeróby, anaeróby, fakultatívne anaeróby, mikroaerofily.

Podľa typov dýchania sú rozdelené do niekoľkých skupín

1) aeróby, pre ktoré je potrebný molekulárny kyslík

2) obligátne aeróby nie sú schopné rásť bez kyslíka, pretože ho využívajú ako akceptor elektrónov.

3) mikroaerofily - schopné rásť v prítomnosti malej koncentrácie O2 (do 2%) 4) anaeróby nepotrebujú voľný kyslík, potrebné E získavajú štiepením, obsahujú veľkú zásobu latentného E

5) obligátne anaeróby – neznášajú ani malé množstvo kyslíka (klostridiálne)

6) fakultatívne anaeróby – prispôsobili sa existencii v podmienkach obsahujúcich kyslík aj v anoxických podmienkach. Procesom dýchania u mikróbov je fosforylácia alebo fermentácia substrátu: glykolýza, fosfoglykonátová dráha a ketodeoxyfosfoglykonátová dráha. Typy fermentácie: kyselina mliečna (bifidobaktérie), kyselina mravčia (enterobaktérie), kyselina maslová (klostridia), kyselina propiónová (propionobaktérie),

2. Antigény, definícia, podmienky antigenicity. Antigénne determinanty, ich štruktúra. Imunochemická špecifickosť antigénov: druh, skupina, typ, orgán, heterošpecifické. Kompletné antigény, haptény, ich vlastnosti.

Antigény sú zlúčeniny s vysokou molekulovou hmotnosťou.

Pri požití vyvolávajú imunitnú reakciu a interagujú s produktmi tejto reakcie.

Kasifikácia antigénov. 1. Podľa pôvodu:

prírodné (bielkoviny, sacharidy, nukleové kyseliny, bakteriálne exo- a endotoxíny, tkanivové a krvné bunky antigény);

umelé (dinitrofenylované bielkoviny a sacharidy);

syntetické (syntetizované polyaminokyseliny).

2. Chemickou povahou:

proteíny (hormóny, enzýmy atď.);

uhľohydráty (dextrán);

nukleové kyseliny (DNA, RNA);

konjugované antigény;

polypeptidy (polyméry a-aminokyselín);

lipidy (cholesterol, lecitín).

3. Podľa genetického vzťahu:

autoantigény (z tkanív vlastného tela);

izoantigény (od geneticky identického darcu);

aloantigény od nepríbuzného darcu rovnakého druhu)

4. Podľa povahy imunitnej odpovede:

1) xenoantigény (od darcu iného druhu). antigény závislé od týmusu;

2) antigény nezávislé od týmusu.

K dispozícii sú tiež:

vonkajšie antigény (vstupujú do tela zvonku);

vnútorné antigény; vznikajú z poškodených molekúl tela, ktoré sú rozpoznané ako cudzie

skryté antigény – špecifické antigény

(napr. nervové tkanivo, šošovkové proteíny a spermie); anatomicky oddelené od imunitného systému histohematickými bariérami počas embryogenézy.

Haptény sú látky s nízkou molekulovou hmotnosťou, ktoré za normálnych podmienok nespôsobujú imunitnú odpoveď, ale keď sa naviažu na molekuly s vysokou molekulovou hmotnosťou, stanú sa imunogénnymi.

Infekčné antigény sú antigény baktérií, vírusov, húb, proteínov.

Odrody bakteriálnych antigénov:

špecifické pre skupinu;

druhovo špecifické;

typovo špecifický.

Podľa lokalizácie v bakteriálnej bunke rozlišujú:

O - AG - polysacharid (časť bunkovej steny baktérií);

lipidA - heterodimér; obsahuje glukozamín a mastné kyseliny;

H - AG; je súčasťou bakteriálnych bičíkov;

K - AG - heterogénna skupina povrchových, kapsulárnych antigénov baktérií;

toxíny, nukleoproteíny, ribozómy a bakteriálne enzýmy.

3. Streptokoky, taxonómia, klasifikácia podľa Lanefielda. Charakterizácia biologických vlastností, faktory patogenity streptokokov. Úloha streptokokov skupiny A v ľudskej patológii. Vlastnosti imunity. Laboratórna diagnostika streptokokovej infekcie.

Rodina Streptococcacea

Rod Streptococcus

Podľa Lesfielda (trieda je založená na rôznych typoch hemolýzy): skupina A (Str. Pyogenes) skupina B (Str. Agalactiae – popôrodné a urogenitálne infekcie, mastitída, vaginitída, sepsa a meningitída u novorodencov), skupina C (Str. Equisimilis), skupina D (Enterococcus, Str. Fecalis). Gr.A - akútny infekčný proces s alergickou zložkou (šarlach, erysipel, myokarditída), grB - hlavný patogén u zvierat, spôsobuje sepsu u detí. GrS-har-n in-hemolýza (spôsobujúca patológiu repar. traktu) GrD-obv. všetky typy hemolýzy, keďže sú normálnym obyvateľom ľudského čreva. Sú to guľovité bunky usporiadané do párov.gr +, chemoorganotrofy, náročné na výživu. Stredy, razm-Xia na krvi alebo sah. agare sa na pevnom médiu tvoria malé kolónie, na kvapaline rast blízko dna, pričom médium zostáva priehľadné. Autor: har-ru rast na krvnom agare: alfa hemolýza (malá oblasť hemolýzy so zelenošedou farbou), beta-hem (priehľadná), nehemol. Aeróby netvoria katalázu.

F-ry pat-tee 1) trieda stena - niektoré majú kapsulu.

2) f-r adhézia-teihoy k-vám

3) proteín M-ochranný, zabraňuje fagocytóze

4) množstvo toxínov: erytrogénno-šarlach, O-streptolyzín = hemolyzín, leukocidín 5) cytotoxíny.

Diagn: 1) b / l: hnis, hlien z hltana - výsev na streche. agar (prítomnosť / neprítomnosť hemolyzačnej zóny), identifikácia pomocou Ag sv-you 2)b / s - nátery podľa Gramu 3) s / l - hľadajte Ab až O-streptolyzín v RSK alebo r-ii presnosti

Liečba:β-laktám a/b. Gr.A spôsobujúce hnisavý zápal, zápal, sprevádzaný hojnou hnisavou tvorbou, sepsou.

Anaeróby(grécka negatívna predpona an- + aē r vzduch + b život) - mikroorganizmy, ktoré sa vyvíjajú v neprítomnosti voľného kyslíka vo svojom prostredí. Nachádzajú sa takmer vo všetkých vzorkách patologického materiálu pri rôznych purulentno-zápalových ochoreniach, sú podmienene patogénne, niekedy patogénne. Rozlišujte fakultatívne a povinné A. Fakultatívne A. sú schopné existovať a množiť sa tak v kyslíku, ako aj v prostredí bez kyslíka. Patria sem E. coli, Yersinia a Streptococcus, Shigella a ďalšie baktérie.

Obligátne A. hynú v prítomnosti voľného kyslíka v prostredí. Delia sa na dve skupiny: baktérie, ktoré tvoria spóry, čiže klostrídie, a baktérie, ktoré netvoria spóry, čiže takzvané neklostridiové anaeróby. Spomedzi klostrídií sa rozlišujú patogény anaeróbnych klostrídiových infekcií - a, klostrídiová infekcia rany, a. Neklostridiové A. zahŕňajú gramnegatívne a grampozitívne tyčinkovité alebo guľovité baktérie: bakteroidy, fusobaktérie, veillonella, peptokoky, peptostreptokoky, propionibaktérie, eubaktérie atď. Neklostridiové A. sú neoddeliteľnou súčasťou normálnej mikroflóry ľudí a zvierat, ale zároveň zohrávajú veľkú úlohu pri vzniku takých hnisavých zápalových procesov, akými sú zápal pobrušnice, pľúc a mozgu, pohrudnice, flegmóna maxilofaciálnej oblasti atď. anaeróbne infekcie, spôsobené neklostridiovými anaeróbmi, odkazuje na endogénne a vyvíja sa hlavne so znížením odolnosti organizmu v dôsledku traumy, chirurgického zákroku, ochladzovania, zhoršenej imunity.

Hlavnou časťou klinicky významných A. sú bakteroidy a fuzobaktérie, peptostreptokoky a spórové grampozitívne tyčinky. Bakteroidy predstavujú asi polovicu hnisavých zápalových procesov spôsobených anaeróbnymi baktériami.

Bacteroides (Bacteroides) - rod gramnegatívnych obligátnych anaeróbnych baktérií čeľade Bacteroidaceae, tyčinky s bipolárnym farbením, veľkosť 0,5-1,5´ 1-15 mikrón, nepohyblivé alebo pohybujúce sa pomocou peritrichóznych bičíkov, majú často polysacharidovú kapsulu, ktorá je faktorom virulencie. Produkujú rôzne toxíny a enzýmy, ktoré pôsobia ako faktory virulencie. Sú heterogénne v citlivosti na antibiotiká: bakteroidy, napríklad skupina B. fragilis, sú odolné voči benzylpenicilínu. Bakteroidy rezistentné na b-laktámové antibiotiká produkujú b-laktamázy (penicilinázy a cefalosporinázy), ktoré ničia penicilín a cefalosporíny. Bakteroidy sú citlivé na niektoré deriváty imidazolu - metronidazol (trichopolum,

flagil), tinidazol, ornidazol - lieky účinné proti rôznym skupinám anaeróbnych baktérií, ako aj chloramfenikol a erytromycín. Bakteroidy sú odolné voči aminoglykozidom – gentamicín, kanamycín, streptomycín, polymyxín, oleandomycín. Významná časť bakteroidov je odolná voči tetracyklínom.

Fusobacteria (Fusobacterium) - rod gramnegatívnych tyčinkovitých obligátnych anaeróbnych baktérií; žijú na sliznici úst a čriev, sú nepohyblivé alebo pohyblivé, obsahujú silný endotoxín. Najčastejšie sa v patologickom materiáli nachádza F. nucleatum a F. necrophorum. Väčšina fuzobaktérií je citlivá na beta-laktámové antibiotiká, existujú však kmene rezistentné na penicilín. Fusobaktérie, s výnimkou F. varium, sú citlivé na klindamycín.

Peptostreptococcus (Peptostreptococcus) je rod grampozitívnych guľovitých baktérií; usporiadané do párov, tetrád, vo forme nepravidelných zhlukov alebo reťazcov. Nemajú bičíky, netvoria spóry. Citlivý na penicilín, karbenicilín, cefalosporíny, chloramfenikol, odolný voči metronidazolu.

Peptococcus (Peptococcus) je rod grampozitívnych guľovitých baktérií, zastúpených jediným druhom P. niger. Vyskytujú sa jednotlivo, v pároch, niekedy v zhlukoch. Netvoria sa bičíky a spóry.

Citlivé na penicilín, karbenicilín, erytromycín, klindamycín, chloramfenikol. Relatívne odolný voči metronidazolu.

Veillonella - rod gramnegatívnych anaeróbnych diplokokov; usporiadané v krátkych reťazcoch, nepohyblivé, netvoria spóry. Citlivé na penicilín, chloramfenikol, tetracyklín, polymyxín, erytromycín, rezistentné na streptomycín, neomycín, vankomycín.

Z ďalších neklostridiových anaeróbnych baktérií izolovaných z patologického materiálu pacientov treba spomenúť grampozitívne propiónové baktérie, gramnegatívne volinely a ďalšie, ktorých význam je menej prebádaný.

Clostridium je rod grampozitívnych, tyčinkovitých anaeróbnych baktérií tvoriacich spóry. Klostrídie sú v prírode široko rozšírené, najmä v pôde, žijú aj v gastrointestinálnom trakte ľudí a zvierat. Asi desať druhov klostrídií je patogénnych pre ľudí a zvieratá: C. perfringens, C. novyii, C. septicum, C. ramosum, C. botulirnim, C. tetani, C. difficile atď. Tieto baktérie tvoria exotoxíny špecifické pre každý druh s vysokou biologickou aktivitou, na ktorú sú ľudia a mnohé živočíšne druhy citlivé. C. difficile sú pohyblivé baktérie s peritrichóznymi bičíkmi. Podľa viacerých vedcov môžu tieto baktérie po iracionálnej antimikrobiálnej terapii po množení spôsobiť pseudomembranózne ochorenia. C. difficile sú citlivé na penicilín, ampicilín, vankomycín, rifampicín,

metronidazol; odolné voči aminoglykozidom.

Pôvodcom anaeróbnej infekcie môže byť ktorýkoľvek typ baktérie, ale častejšie sú tieto infekcie spôsobené rôznymi asociáciami mikróbov: anaeróbno-anaeróbne (bakteroidy a fuzobaktérie); anaeróbno-aeróbne (bakteroidy a

Baktérie sú prítomné všade v našom svete. Sú všade a všade a množstvo ich odrôd je jednoducho úžasné.

V závislosti od potreby prítomnosti kyslíka v živnom médiu na realizáciu vitálnej aktivity sa mikroorganizmy klasifikujú do nasledujúcich typov.

• Obligátne aeróbne baktérie, ktoré sa zhromažďujú v hornej časti živného média, flóra obsahovala maximálne množstvo kyslíka.
• Obligátne anaeróbne baktérie, ktoré sa nachádzajú v spodnej časti prostredia, čo najďalej od kyslíka.
• Fakultatívne baktérie žijú hlavne v hornej časti, ale môžu byť distribuované po celom prostredí, pretože nie sú závislé od kyslíka.
• Mikroaerofily preferujú nízku koncentráciu kyslíka, hoci sa zhromažďujú v hornej časti prostredia.
• Aerotolerantné anaeróby sú rovnomerne rozložené v živnom médiu, necitlivé na prítomnosť alebo neprítomnosť kyslíka.

Pojem anaeróbnych baktérií a ich klasifikácia

Pojem „anaeróby“ sa objavil v roku 1861 vďaka práci Louisa Pasteura.

Anaeróbne baktérie sú mikroorganizmy, ktoré sa vyvíjajú bez ohľadu na prítomnosť kyslíka v živnom médiu. Dostávajú energiu fosforyláciou substrátu. Existujú fakultatívne a povinné aeróby, ako aj iné typy.

Najvýznamnejšími anaeróbmi sú bakteroidy

Najdôležitejšie aeróby sú bakteroidy. O päťdesiat percent všetkých purulentno-zápalových procesov, ktorých pôvodcami môžu byť anaeróbne baktérie, sú bakteroidy.

Bacteroides je rod gramnegatívnych obligátnych anaeróbnych baktérií. Ide o tyčinky s bipolárnym sfarbením, ktorých veľkosť nepresahuje 0,5-1,5 x 15 mikrónov. Produkujú toxíny a enzýmy, ktoré môžu spôsobiť virulenciu. Rôzne bakteroidy majú rôznu rezistenciu voči antibiotikám: sú rezistentné aj citlivé na antibiotiká.

Výroba energie v ľudských tkanivách

Niektoré tkanivá živých organizmov majú zvýšenú odolnosť voči nízkemu obsahu kyslíka. Za štandardných podmienok prebieha syntéza adenozíntrifosfátu aeróbne, pri zvýšenej fyzickej námahe a zápalových reakciách sa však do popredia dostáva anaeróbny mechanizmus.

Adenozíntrifosfát (ATP) Je to kyselina, ktorá hrá dôležitú úlohu pri tvorbe energie v tele. Existuje niekoľko možností syntézy tejto látky: jedna aeróbna a až tri anaeróbne.

Anaeróbne mechanizmy syntézy ATP zahŕňajú:

• refosforylácia medzi kreatínfosfátom a ADP;
• transfosforylačná reakcia dvoch molekúl ADP;
• anaeróbne odbúravanie zásob glukózy alebo glykogénu v krvi.

Pestovanie anaeróbnych organizmov

Na pestovanie anaeróbov existujú špeciálne metódy. Spočívajú v nahradení vzduchu zmesami plynov v utesnených termostatoch.

Ďalším spôsobom je pestovanie mikroorganizmov v živnom médiu, do ktorého sa pridávajú redukčné látky.

Kultivačné médiá pre anaeróbne organizmy

Existujú bežné živné pôdy a diferenciálne diagnostické živné pôdy. Medzi bežné patrí médium Wilson-Blair a médium Kitt-Tarozzi. Pre diferenciálnu diagnostiku - Hissovo médium, Resselovo médium, Endo médium, Ploskirevovo médium a bizmutovo-sulfitový agar.

Základom pre médium Wilson-Blair je agar-agar s prídavkom glukózy, siričitanu sodného a chloridu železitého. Čierne kolónie anaeróbov sa tvoria najmä v hĺbke agarového stĺpca.

Resselovo (Russellovo) médium sa používa pri štúdiu biochemických vlastností baktérií, ako sú Shigella a Salmonella. Obsahuje tiež agar-agar a glukózu.

Streda Ploskirev inhibuje rast mnohých mikroorganizmov, preto sa používa na diferenciálne diagnostické účely. V takomto prostredí sa dobre rozvíjajú patogény brušného týfusu, dyzentérie a iných patogénnych baktérií.

Hlavným účelom agaru so siričitanom bizmutitým je izolácia salmonely v jej čistej forme. Toto prostredie je založené na schopnosti Salmonella produkovať sírovodík. Toto médium je v použitej technike podobné médiu Wilson-Blair.

Anaeróbne infekcie

Väčšina anaeróbnych baktérií žijúcich v ľudskom alebo zvieracom tele môže spôsobiť rôzne infekcie. Infekcia sa spravidla vyskytuje počas obdobia oslabenej imunity alebo porušenia všeobecnej mikroflóry tela. Existuje tiež možnosť infekcie patogénmi z vonkajšieho prostredia, najmä v neskorej jeseni a zime.

Infekcie spôsobené anaeróbnymi baktériami sú zvyčajne spojené s flórou ľudských slizníc, to znamená s hlavnými biotopmi anaeróbov. Typicky, tieto infekcie viacero spúšťačov naraz(do 10).

Presný počet chorôb spôsobených anaeróbmi je takmer nemožné určiť kvôli ťažkostiam pri zbere materiálov na analýzu, preprave vzoriek a kultivácii samotných baktérií. Najčastejšie sa tento typ baktérií nachádza pri chronických ochoreniach.

Anaeróbne infekcie postihujú ľudí všetkých vekových skupín. Zároveň je úroveň infekčných ochorení u detí vyššia.

Anaeróbne baktérie môžu spôsobiť rôzne intrakraniálne ochorenia (meningitída, abscesy a iné). Distribúcia sa spravidla vyskytuje v krvnom obehu. Pri chronických ochoreniach môžu anaeróby spôsobiť patológie v oblasti hlavy a krku: zápal stredného ucha, lymfadenitída, abscesy. Tieto baktérie sú nebezpečné pre gastrointestinálny trakt aj pre pľúca. Pri rôznych ochoreniach urogenitálneho ženského systému existuje aj riziko vzniku anaeróbnych infekcií. Rôzne ochorenia kĺbov a kože môžu byť výsledkom vývoja anaeróbnych baktérií.

Príčiny anaeróbnych infekcií a ich symptómy

Infekcie sú spôsobené všetkými procesmi, počas ktorých aktívne anaeróbne baktérie vstupujú do tkanív. Tiež rozvoj infekcií môže spôsobiť zhoršené zásobovanie krvou a nekrózu tkaniva (rôzne poranenia, nádory, edémy, cievne ochorenia). Infekcie úst, uhryznutie zvieratami, pľúcne ochorenia, zápalové ochorenia panvy a mnohé ďalšie ochorenia môžu byť tiež spôsobené anaeróbmi.

V rôznych organizmoch sa infekcia vyvíja rôznymi spôsobmi. To je ovplyvnené typom patogénu a stavom ľudského zdravia. Kvôli ťažkostiam spojeným s diagnostikou anaeróbnych infekcií je záver často založený na predpokladoch. Líšia sa v niektorých črtách infekcie spôsobenej neklostridiové anaeróby.

Prvými príznakmi infekcie tkanív aeróbmi sú hnisanie, tromboflebitída, tvorba plynu. Niektoré nádory a novotvary (črevné, maternicové a iné) sú sprevádzané aj vývojom anaeróbnych mikroorganizmov. Pri anaeróbnych infekciách sa môže objaviť nepríjemný zápach, jeho absencia však nevylučuje anaeróby ako pôvodcu infekcie.

Vlastnosti získavania a prepravy vzoriek

Úplne prvou štúdiou pri určovaní infekcií spôsobených anaeróbmi je vizuálna kontrola. Častou komplikáciou sú rôzne kožné lézie. Dôkazom vitálnej aktivity baktérií bude aj prítomnosť plynu v infikovaných tkanivách.

Pre laboratórny výskum a stanovenie presnej diagnózy je v prvom rade potrebné kompetentne získať vzorku hmoty z postihnutej oblasti. Na to sa používa špeciálna technika, vďaka ktorej sa do vzoriek nedostane bežná flóra. Najlepšou metódou je aspirácia priamou ihlou. Získavanie laboratórneho materiálu nátermi sa neodporúča, ale je možné.

Vzorky nevhodné na ďalšiu analýzu zahŕňajú:

• spúta získaný samovylučovaním;
• vzorky získané počas bronchoskopie;
• šmuhy z vaginálnych klenieb;
• moč s voľným močením;
• výkaly.

Na výskum je možné použiť:

• krv;
• pleurálna tekutina;
• transtracheálne aspiráty;
• hnis získaný z abscesovej dutiny;
• cerebrospinálna tekutina;
• punkcie pľúc.

Vzorky prepravy je potrebné čo najskôr v špeciálnej nádobe alebo plastovom vrecku s anaeróbnymi podmienkami, pretože aj krátkodobá interakcia s kyslíkom môže spôsobiť smrť baktérií. Kvapalné vzorky sa prepravujú v skúmavke alebo v injekčných striekačkách. Výtery so vzorkami sa prepravujú v skúmavkách s oxidom uhličitým alebo vopred pripraveným médiom.

Liečba anaeróbnej infekcie

V prípade diagnostiky anaeróbnej infekcie pre adekvátnu liečbu je potrebné dodržiavať nasledovné zásady:

• toxíny produkované anaeróbmi sa musia neutralizovať;
• biotop baktérií by sa mal zmeniť;
• šírenie anaeróbov musí byť lokalizované.

Dodržiavať tieto zásady pri liečbe sa používajú antibiotiká, ktoré postihujú anaeróbne aj aeróbne organizmy, keďže flóra pri anaeróbnych infekciách je často zmiešaná. Zároveň pri predpisovaní liekov musí lekár vyhodnotiť kvalitatívne a kvantitatívne zloženie mikroflóry. Činidlá, ktoré sú aktívne proti anaeróbnym patogénom, zahŕňajú: penicilíny, cefalosporíny, chamfenikol, fluorochinolo, metranidazol, karbapenémy a iné. Niektoré lieky majú obmedzený účinok.

Na kontrolu biotopu baktérií sa vo väčšine prípadov používa chirurgická intervencia, ktorá sa prejavuje pri liečbe postihnutých tkanív, drenáži abscesov a zabezpečení normálneho krvného obehu. Chirurgické metódy by sa nemali ignorovať kvôli riziku život ohrozujúcich komplikácií.

Niekedy používané pomocné terapie, a tiež pre ťažkosti spojené s presným určením pôvodcu infekcie sa používa empirická liečba.

S rozvojom anaeróbnych infekcií v ústnej dutine sa tiež odporúča pridať do stravy čo najviac čerstvého ovocia a zeleniny. Najužitočnejšie sú jablká a pomaranče. Obmedzenie podlieha mäsovým jedlám a rýchlemu občerstveniu.

anaeróbna infekcia

Etiológia, patogenéza, antibiotická terapia.

Predslov ................................................. ...................................................................... ... jeden

Úvod ................................................. ............................................. 2

1.1 Definícia a charakteristika ...................................................... ............... 2

1.2 Zloženie mikroflóry hlavných biotopov človeka .......... 5

2. Faktory patogenity anaeróbnych mikroorganizmov .......... 6

2.1. Úloha anaeróbnej endogénnej mikroflóry v patológii

osoba ................................................. ................................................................... ……. osem

3. Hlavné formy anaeróbnej infekcie ........................................................ 10

3.1. Pleuropulmonálna infekcia ................................................................ ........................ desať

3.2. Infekcia diabetickej nohy ................................................... ...................................... desať

3.3. Bakteriémia a sepsa ................................................................... ................ ................. jedenásť

3.4. Tetanus................................................. ................................ jedenásť

3.5. Hnačka................................................. ......................................... 12

3.6. Chirurgická infekcia rán a mäkkých tkanív ...................................... 12

3.7. Infekcia mäkkých tkanív produkujúca plyn .................................................. ... 12

3.8. Klostridiová myonekróza ...................................................... ................... ... 12

3.9. Pomaly sa rozvíjajúca infekcia nekrotickej rany…13

3.10. Intraperitoneálna infekcia ................................................................... ………….. 13

3.11. Charakteristika experimentálnych anaeróbnych abscesov ..... 13

3.12. Pseudomembranózna kolitída ...................................................... ...................... ..........štrnásť

3.13. Pôrodnícka a gynekologická infekcia ...................................................... .........14

3.14. Anaeróbna infekcia u pacientov s rakovinou…………..15

4. Laboratórna diagnostika............................................................ ................. ................pätnásť

4.1. Výskumný materiál ................................................... ................... ......................pätnásť

4.2. Etapy materiálového výskumu v laboratóriu................................................. ....16

4.3. Priame štúdium materiálu ................................................. ...........................16

4.4. Metódy a systémy vytvárania anaeróbnych podmienok................................16

4.5. Živné pôdy a kultivácia ............................................................ 17

5. Antibiotická liečba anaeróbnej infekcie .................................................. ... 21

5.1. Charakteristika hlavných antimikrobiálnych liekov,

používa sa pri liečbe anaeróbnej infekcie .................................................21

5.2. Kombinácia beta-laktámových liekov a inhibítorov

beta-laktamázy ................................................... ...................................................... ..24

5.3. Klinický význam testovania anaeróbnej citlivosti

mikroorganizmov na antimikrobiálne liečivá.......................................24

6. Korekcia črevnej mikroflóry ...................................................................26

1. Záver................................................. .........................................27
2. Autori……………………………………………………………………….27

Predslov

Posledné roky sú charakteristické zrýchleným rozvojom mnohých oblastí všeobecnej a klinickej mikrobiológie, čo je pravdepodobne spôsobené jednak našim adekvátnejším chápaním úlohy mikroorganizmov pri vzniku chorôb, ako aj potrebou lekárov neustále využívať informácie o etiológii. chorôb, vlastností patogénov s cieľom úspešného manažmentu pacientov a dosiahnutia uspokojivých výsledkov chemoterapie alebo chemoprofylaxie. Jednou z takýchto rýchlo sa rozvíjajúcich oblastí mikrobiológie je klinická anaeróbna bakteriológia. V mnohých krajinách sveta sa tejto časti mikrobiológie venuje značná pozornosť. Sekcie venované anaeróbom a anaeróbnym infekciám sú zaradené do vzdelávacích programov pre lekárov rôznych špecializácií. Žiaľ, u nás sa tomuto úseku mikrobiológie, ako z hľadiska prípravy odborníkov, tak aj z hľadiska diagnostickej stránky práce bakteriologických laboratórií, nevenuje dostatočná pozornosť. Metodická príručka „Anaeróbna infekcia“ pokrýva hlavné časti tohto problému – definíciu a klasifikáciu, charakteristiku anaeróbnych mikroorganizmov, hlavné biotopy anaeróbov v organizme, charakteristiku foriem anaeróbnej infekcie, smery a metódy laboratórnych diagnostika, ako aj komplexná antibakteriálna -rapia (antimikrobiálne látky, mikrobiálna rezistencia/citlivosť, metódy jej stanovenia a prekonania). Prirodzene, cieľom manuálu nie je poskytnúť podrobné odpovede na všetky aspekty anaeróbnej infekcie. Je celkom zrejmé, že mikrobiológovia, ktorí chcú pracovať v oblasti anaeróbnej bakteriológie, musia prejsť špeciálnym vzdelávacím cyklom, dokonalejšie zvládnuť problematiku mikrobiológie, laboratórneho vybavenia, metód indikácie, kultivácie a identifikácie anaeróbov. Dobré skúsenosti sa získavajú aj účasťou na špeciálnych seminároch a sympóziách o anaeróbnej infekcii na národnej a medzinárodnej úrovni. Tieto metodické odporúčania sú určené pre bakteriológov, lekárov rôznych špecializácií (chirurgov, terapeutov, endokrinológov, pôrodníkov-gynekológov, pediatrov), študentov lekárskych a biologických fakúlt, učiteľov lekárskych univerzít a lekárskych fakúlt.

Úvod

Prvé myšlienky o úlohe anaeróbnych mikroorganizmov v ľudskej patológii sa objavili pred mnohými storočiami. Ešte v 4. storočí pred Kristom Hippokrates podrobne opísal tetanovú kliniku a v 4. storočí nášho letopočtu opísal Xenofón prípady akútnej nekrotizujúcej ulceróznej gingivitídy u gréckych vojakov. Klinický obraz aktinomykózy opísal Langenbeck v roku 1845. V tom čase však nebolo jasné, ktoré mikroorganizmy spôsobujú tieto choroby, aké sú ich vlastnosti, rovnako ako pojem anaerobióza chýbal až do roku 1861, keď Louis Pasteur publikoval klasickú prácu o štúdiu Vibrio. butyrigue a nazval organizmy žijúce v neprítomnosti vzduchu „anaeróby“ (17). Následne Louis Pasteur (1877) izoloval a kultivoval Clostridium septicum , a Izrael v roku 1878 opísal aktinomycéty. Pôvodcom tetanu je Clostridium tetani - identifikoval v roku 1883 N. D. Monastyrsky a v roku 1884 A. Nikolayer. Prvé štúdie pacientov s klinickou anaeróbnou infekciou uskutočnil Levy v roku 1891. Úlohu anaeróbov vo vývoji rôznych medicínskych patológií prvýkrát opísal a argumentoval Veiloon. a Zuber v rokoch 1893-1898. Popísali rôzne typy ťažkých infekcií spôsobených anaeróbnymi mikroorganizmami (gangréna pľúc, apendicitída, abscesy pľúc, mozgu, panvy, meningitída, mastoiditída, chronický zápal stredného ucha, bakteriémia, parametritída, bartholinitída, purulentná artritída). Okrem toho vyvinuli mnoho metodických prístupov k izolácii a kultivácii anaeróbov (14). Začiatkom 20. storočia sa tak mnohé z anaeróbnych mikroorganizmov stali známymi, vytvorila sa predstava o ich klinickom význame a vytvorila sa vhodná technika na kultiváciu a izoláciu anaeróbnych mikroorganizmov. Od 60. rokov až po súčasnosť sa naliehavosť problému anaeróbnych infekcií neustále zvyšuje. Je to spôsobené jednak etiologickou úlohou anaeróbnych mikroorganizmov v patogenéze chorôb a vývojom rezistencie na široko používané antibakteriálne liečivá, ako aj ťažkým priebehom a vysokou mortalitou chorôb, ktoré spôsobujú.

1.1. Definícia a charakteristika

V klinickej mikrobiológii sa mikroorganizmy bežne klasifikujú na základe ich vzťahu k atmosférickému kyslíku a oxidu uhličitému. To sa dá ľahko overiť pri inkubácii mikroorganizmov na krvnom agare za rôznych podmienok: a) na normálnom vzduchu (21 % kyslíka); b) v podmienkach C02 inkubátora (15 % kyslíka); c) za mikroaerofilných podmienok (5 % kyslíka) d) anaeróbnych podmienok (0 % kyslíka). Pomocou tohto prístupu možno baktérie rozdeliť do 6 skupín: obligátne aeróby, mikroaerofilné aeróby, fakultatívne anaeróby, aerotolerantné anaeróby, mikroaerotolerantné anaeróby, obligátne anaeróby. Tieto informácie sú užitočné na primárnu identifikáciu aeróbov aj anaeróbov.

Aeróby. Pre rast a rozmnožovanie potrebujú obligátne aeróby atmosféru obsahujúcu molekulárny kyslík v koncentrácii 15-21 % alebo CO; inkubátor. Príkladmi povinných aeróbov sú mykobaktérie, Vibrio cholerae a niektoré huby. Tieto mikroorganizmy získavajú väčšinu svojej energie procesom dýchania.

mikroaerofily(mikroaerofilné aeróby). Na reprodukciu potrebujú aj kyslík, ale v koncentráciách nižších, než aké sú prítomné v atmosfére miestnosti. Gonokoky a Campylobacter sú príkladmi mikroaerofilných baktérií a uprednostňujú atmosféru s obsahom O2 okolo 5 %.

mikroaerofilné anaeróby. Baktérie schopné rásť v anaeróbnych a mikroaerofilných podmienkach, ale neschopné rásť v CO2 inkubátore alebo vzdušnom prostredí.

Anaeróby. Anaeróby sú mikroorganizmy, ktoré k životu a rozmnožovaniu nepotrebujú kyslík. Obligátne anaeróby sú baktérie, ktoré rastú len za anaeróbnych podmienok, t.j. v atmosfére bez kyslíka.

Aerotolerantné mikroorganizmy. Dokážu rásť v atmosfére obsahujúcej molekulárny kyslík (vzduch, CO2 inkubátor), ale najlepšie rastú v anaeróbnych podmienkach.

Fakultatívne anaeróby(voliteľné aeróby). Schopný prežiť v prítomnosti alebo neprítomnosti kyslíka. Mnohé baktérie izolované od pacientov sú fakultatívne anaeróby (enterobaktérie, streptokoky, stafylokoky).

kapnofilov. Množstvo baktérií, ktoré rastú lepšie v prítomnosti zvýšených koncentrácií CO2, sa nazývajú kapnofily alebo kapnofilné organizmy. Bakteroidy, fuzobaktérie, hemoglobinofilné baktérie sú kapnofily, pretože lepšie rastú v atmosfére obsahujúcej 3-5 % CO 2 (2,

19,21,26,27,32,36).

Hlavné skupiny anaeróbnych mikroorganizmov sú uvedené v tabuľke 1. (42, 43, 44).

Tabuľkaja. Najdôležitejšie anaeróbne mikroorganizmy

Rod	Druhy		stručný popis
Bacteroides	AT. fragilis AT. vulgatus AT. distansonis AT. eggerthii		Gramnegatívne spóry netvoriace tyčinky
Prevotella	P. melaninogenicus P. bivia P. buccalis P. denticola P. intermedia
Porphyromonas	P. asaccharolyticum P. endodontalis P. gingivalis			Gramnegatívne spóry netvoriace tyčinky
Ctostridium	C. perfringens C. ramosum C. septicum C. novyi C. sporogenes C. sordelii C. tetani C. botulinum C. difficile		Grampozitívne, spóry tvoriace tyčinky alebo bacily
Actinomyces	ALE. Izrael A. bovis
Pseudoramibakter *	P. alaktolytikum		Grampozitívne tyčinky netvoriace spóry
		E. lentum E.rectale E. limosum	Grampozitívne tyčinky netvoriace spóry
Bifidobacterium		B. eriksonii B. adolescentis B.breve	Gram-pozitívne tyčinky
Propionobacterium		P. acnes P. avidum P. granulosum P. propionica**	Gram-pozitívne. tyčinky netvoriace spóry
Lactobacillus		L. catenaforme L. acidophilus	Gram-pozitívne tyčinky
Peptokok		P. magnus P. saccharolyticus P. asaccharolyticus
Peptostreptokok		P. anaeróbne P. intermedius P.mikros P. productus	Grampozitívne koky netvoriace spóry
Veilonella		V. parvula	Gramnegatívne koky netvoriace spóry
Fusobacterium		F. nucleatum F. necrophorum F. varium F. mortiferum	Fusiform palice
kampylobakter		C. plod C.jejuni	Gramnegatívne, tenké, špirálovité tyčinky netvoriace spóry

* Eubacterium alaclolytikum preklasifikovaný ako Pseudoramibakter alaktolytikum (43,44)

** predtým Arachnia propionica (44)

*** synonymá F. pseudonecrophorum, F. necrophorum biovar OD(42,44)

1.2. Zloženie mikroflóry hlavných ľudských biotopov

Etiológia infekčných ochorení prešla v posledných desaťročiach výraznými zmenami. Ako je známe, predtým hlavným nebezpečenstvom pre ľudské zdravie boli akútne nákazlivé infekcie: brušný týfus, úplavica, salmonelóza, tuberkulóza a mnohé iné, ktoré sa prenášali najmä exogénnou cestou. Hoci tieto infekcie stále zostávajú spoločensky významné a v súčasnosti ich medicínsky význam opäť stúpa, vo všeobecnosti sa ich úloha výrazne znížila. Zároveň sa zvyšuje úloha oportúnnych mikroorganizmov, predstaviteľov normálnej mikroflóry ľudského tela. Zloženie normálnej ľudskej mikroflóry zahŕňa viac ako 500 druhov mikroorganizmov. Normálna mikroflóra žijúca v ľudskom tele je z veľkej časti zastúpená anaeróbmi (tabuľka 2).

Anaeróbne baktérie, ktoré obývajú ľudskú kožu a sliznice, vykonávajú mikrobiálnu transformáciu substrátov exogénneho a endogénneho pôvodu, produkujú široké spektrum rôznych enzýmov, toxínov, hormónov a iných biologicky aktívnych zlúčenín, ktoré sa absorbujú a viažu sa na komplementárne receptory a ovplyvňujú funkcie buniek a orgánov. Znalosť zloženia špecifickej normálnej mikroflóry určitých anatomických oblastí je užitočná na pochopenie etiológie infekčných procesov. Súhrn druhov mikroorganizmov obývajúcich určitú anatomickú oblasť sa nazýva domorodá mikroflóra. Navyše, detekcia špecifických mikroorganizmov vo významnom množstve na diaľku alebo na neobvyklom mieste pre bývanie len zdôrazňuje ich účasť na rozvoji infekčného procesu (11, 17, 18, 38).

Dýchacie cesty. Mikroflóra horných dýchacích ciest je veľmi rôznorodá a zahŕňa viac ako 200 druhov mikroorganizmov, ktoré sú súčasťou 21 rodov. 90 % slinných baktérií sú anaeróby (10, 23). Väčšina z týchto mikroorganizmov nie je klasifikovaná modernými metódami taxonómie a nie sú významné pre patológiu. Dýchacie cesty zdravých ľudí sú najčastejšie osídlené nasledujúcimi mikroorganizmami: Streptococcus pneumoniae- 25-70 %; H aemophilus chrípky- 25-85%; Streptococcus pyogenes- 5-10%; Neisseria meningitidis- 5-15 %. Anaeróbne mikroorganizmy ako napr Fusobacterium, Bacteroides spiralis, Peptostreptokok, Peptokok, Veilonella a niektoré typy Actinomyces nachádza takmer u všetkých zdravých ľudí. Koliformné baktérie sa nachádzajú v dýchacích cestách u 3-10% zdravých ľudí. Zvýšená kolonizácia dýchacích ciest týmito mikroorganizmami bola zistená u alkoholikov, osôb s ťažkým priebehom ochorenia, u pacientov s antibakteriálnou terapiou potláčajúcou normálnu mikroflóru, ako aj u osôb s narušenými funkciami imunitného systému.

Tabuľka 2. Kvantitatívny obsah mikroorganizmov v biotopoch

normálne ľudské telo

Populácie mikroorganizmov v dýchacom trakte sa prispôsobujú určitým ekologickým nikám (nos, hltan, jazyk, gingiválne štrbiny). Adaptácia mikroorganizmov na tieto biotopy je určená afinitou baktérií k určitým typom buniek alebo povrchov, to znamená, že je určená bunkovým alebo tkanivovým tropizmom. Napríklad, Streptococcus salivárius dobre prilieha k epitelu líca a dominuje v zložení bukálnej sliznice. adhézne baktérie-

riy môže tiež vysvetliť patogenézu určitých chorôb. Streptococcus pyogenes dobre priľne k epitelu hltana a často spôsobuje faryngitídu, E. coli má afinitu k epitelu močového mechúra, a preto spôsobuje cystitídu.

Kožené. Pôvodnú kožnú mikroflóru predstavujú baktérie najmä týchto rodov: Staphylococcus, Mikrokok, spolrynobaktérie, Propionobacterium, Brevibacterium a Acinetobacter. Často sú prítomné aj kvasinky rodu pityrosporium. Anaeróby sú zastúpené prevažne grampozitívnymi baktériami rodu propi- onobacterium (zvyčajne Propionobacterium akné). Gram-pozitívne koky (Peptostreptokok spp.) a Gram-pozitívne baktérie rodu Eubacterium prítomný u niektorých jedincov.

Uretra. Baktérie, ktoré kolonizujú distálnu uretru, sú stafylokoky, nehemolytické streptokoky, difteroidy a v malom počte prípadov rôzni zástupcovia čeľade Enterobacteriaceae. Anaeróby sú vo väčšej miere zastúpené gramnegatívnymi baktériami - BacteroidesaFusobacterium spp..

Vagína. Asi 50% baktérií z tajomstva krčka maternice a vagíny sú anaeróby. Väčšinu anaeróbov predstavujú laktobacily a peptostreptokoky. Prevo-hovory sa často nachádzajú - P. bivia a P. disiens. Okrem toho grampozitívne baktérie rodu Mobiluncus a Clostridium.

Črevá. Z 500 druhov, ktoré obývajú ľudské telo, žije približne 300 až 400 druhov v črevách. Nasledujúce anaeróbne baktérie sa nachádzajú v najväčšom počte v čreve: Bacteroides, Bifidobacterium, Clostridium, Eubacterium, LactobacillusaPeptostrepto- kokus. Bakteroidy sú dominantné mikroorganizmy. Zistilo sa, že na jednu bunku Escherichia coli pripadá tisíc buniek bakteroidov.

2. Faktory patogenity anaeróbnych mikroorganizmov

Patogenita mikroorganizmov znamená ich potenciálnu schopnosť spôsobiť ochorenie. Vznik patogenity u mikróbov je spojený so získaním množstva vlastností, ktoré zabezpečujú schopnosť uchytenia sa, prieniku a šírenia v hostiteľskom organizme, odolávajú jeho obranným mechanizmom a spôsobujú poškodenie životne dôležitých orgánov a systémov. Zároveň je známe, že virulencia mikroorganizmov je polydeterminovaná vlastnosť, ktorá sa plne realizuje len v organizme hostiteľa citlivého na patogén.

V súčasnosti sa rozlišuje niekoľko skupín faktorov patogenity:

a) adhezíny alebo faktory pripojenia;

b) adaptačné faktory;

c) invazívne alebo penetračné faktory

d) kapsula;

e) cytotoxíny;

f) endotoxíny;

g) exotoxíny;

h) enzýmy toxíny;

i) faktory modulujúce imunitný systém;

j) superantigény;

k) proteíny tepelného šoku (2, 8, 15, 26, 30).

Štádiá a mechanizmy, rozsah reakcií, interakcií a vzťahov na molekulárnej, bunkovej a organizačnej úrovni medzi mikroorganizmami a hostiteľským organizmom sú veľmi zložité a rôznorodé. Poznatky o faktoroch patogenity anaeróbnych mikroorganizmov a ich praktické využitie na prevenciu chorôb zatiaľ nie sú dostatočné. V tabuľke 3 sú uvedené hlavné skupiny patogénnych faktorov anaeróbnych baktérií.

Tabuľka 3. Faktory patogenity anaeróbnych mikroorganizmov

Fáza interakcie		Faktor		Druhy
Priľnavosť		Fimbria kapsulárne polysacharidy hemaglutiníny
Invázia		Fosfolipáza C Proteázy
Poškodenie tkaniny	Exotoxíny Hemolyzíny Proteázy kolagenáza fibrinolyzín neuraminidáza heparináza Chondriitín sulfát glukuronidáza N-acetyl-glukózaminidázové cytotoxíny Enterotoxíny neurotoxíny		P. melaninogenica P. melaninogenica
Faktory, ktoré potláčajú imunitný systém	Metabolické produkty Lipopolysacharidy (O-antigén) Imunoglobulínové proteázy (G, A, M) C3 a C5 konvertáza Proteáza a 2 -mikroglobulín Metabolické produkty Mastné kyseliny anaeróbov Zlúčeniny síry Oxidoreduktáza Beta-laktamázy		Väčšina anaeróbov
Aktivátory faktorov poškodenia	Lipopolysacharidy (O-antigén) Povrchové štruktúry

Teraz sa zistilo, že faktory patogenity anaeróbnych mikroorganizmov sú určené geneticky. Boli identifikované chromozomálne a plazmidové gény, ako aj transpozóny kódujúce rôzne faktory patogenity. Štúdium funkcií týchto génov, mechanizmov a vzorcov expresie, prenosu a cirkulácie v populácii mikroorganizmov je veľmi dôležitým problémom.

2.1. Úloha anaeróbnej endogénnej mikroflóry v ľudskej patológii

Anaeróbne mikroorganizmy normálnej mikroflóry sa veľmi často stávajú pôvodcami infekčných procesov lokalizovaných v rôznych anatomických častiach tela. Tabuľka 4 ukazuje frekvenciu anaeróbnej mikroflóry vo vývoji patológie. (2, 7, 11, 12, 18, 24, 27).

Je možné sformulovať množstvo dôležitých zovšeobecnení týkajúcich sa etiológie a patogenézy väčšiny typov anaeróbnych infekcií: 1) zdrojom anaeróbnych mikroorganizmov je normálna mikroflóra pacientov z ich vlastného gastrointestinálneho, respiračného alebo urogenitálneho traktu; 2) zmeny vlastností tkaniva v dôsledku traumy a/alebo hypoxie poskytujú vhodné podmienky pre rozvoj sekundárnej alebo oportúnnej anaeróbnej infekcie; 3) anaeróbne infekcie sú spravidla polymikrobiálne a sú často spôsobené zmesou niekoľkých typov anaeróbnych a aeróbnych mikroorganizmov, ktoré synergicky vykazujú škodlivý účinok; 4) infekcia je sprevádzaná tvorbou a uvoľňovaním silného zápachu asi v 50% prípadov (anaeróby netvoriace spóry syntetizujú prchavé mastné kyseliny, ktoré spôsobujú tento zápach); 5) infekcia je charakterizovaná tvorbou plynov, nekrózou tkaniva, rozvojom abscesov a gangrény; 6) infekcia sa vyvinie počas liečby aminoglykozidovými antibiotikami (bakteroidy sú voči nim rezistentné); 7) pozoruje sa čierne sfarbenie exsudátu (porphyromonas a prevotella produkujú tmavohnedý alebo čierny pigment); 8) infekcia má zdĺhavý, pomalý, často subklinický priebeh; 9) sú rozsiahle nekrotické zmeny tkaniva, nesúlad medzi závažnosťou klinických príznakov a objemom deštruktívnych zmien, nízke krvácanie na reze.

Hoci anaeróbne baktérie môžu spôsobiť vážne a smrteľné infekcie, spustenie infekcie vo všeobecnosti závisí od stavu obranných faktorov organizmu, t.j. funkcie imunitného systému (2, 5, 11). Princípy liečby takýchto infekcií zahŕňajú odstránenie odumretého tkaniva, drenáž, obnovenie dostatočného krvného obehu, odstránenie cudzorodých látok a použitie aktívnej antimikrobiálnej terapie primeranej patogénu, v primeranej dávke a dĺžke.

Tabuľka 4. Etiologická úloha anaeróbnej mikroflóry

Vo vývoji choroby

Choroby	Počet vyšetrených	Frekvencia izolácie anaeróbov
Hlava a krk Netraumatické abscesy hlavy Chronická sinusitída Infekcie perimandibulárneho priestoru
Hrudný kôš Aspiračná pneumónia pľúcny absces
Brucho Abscesy alebo peritonitída Apendicitída pečeňový absces
ženský pohlavný trakt zmiešané typy Abscesy panvy Zápalové procesy			33 (100%) 22 (88%)
mäkkých tkanív infekcia rany Kožné abscesy Diabetické vredy končatín Neklostridiová celulitída
bakteriémia Všetky kultúry Intraabdominálna sepsa Septický potrat

3. Hlavné formy anaeróbnej infekcie

3.1. Pleuropulmonálna infekcia

Etiologicky významné anaeróbne mikroorganizmy v tejto patológii sú predstaviteľmi normálnej mikroflóry ústnej dutiny a horných dýchacích ciest. Sú pôvodcami rôznych infekcií, vrátane aspiračnej pneumónie, nekrotizujúcej pneumónie, aktinomykózy a pľúcneho abscesu. Hlavné príčiny pleuropulmonálnych ochorení sú uvedené v tabuľke 5.

Tabuľka 5. Anaeróbne baktérie spôsobujúce

pleuropulmonálna infekcia

Medzi faktory, ktoré prispievajú k rozvoju anaeróbnej pleuropulmonálnej infekcie u pacienta, patrí aspirácia normálnej mikroflóry (v dôsledku straty vedomia, dysfágie, prítomnosti mechanických predmetov, obštrukcie, zlej ústnej hygieny, nekrotizácie pľúcneho tkaniva) a hematogénne šírenie mikroorganizmov. Ako je možné vidieť z tabuľky 5, aspiračnú pneumóniu najčastejšie spôsobujú organizmy predtým označované ako "orálne bakteroidné" druhy (v súčasnosti druhy Prevotella a Porphyromonas), Fusobacterium a Peptostreptococcus. Spektrum baktérií izolovaných z anaeróbneho empyému a pľúcneho abscesu je takmer rovnaké.

3.2. Infekcia diabetickej nohy

Spomedzi viac ako 14 miliónov diabetikov v Spojených štátoch je zápach nôh najčastejšou infekčnou príčinou hospitalizácie. Tento typ infekcie pacienti v počiatočnom štádiu často ignorujú a niekedy ho lekári neadekvátne liečia. Vo všeobecnosti sa pacienti nesnažia starostlivo a pravidelne vyšetrovať dolné končatiny a nedodržiavajú odporúčania lekárov týkajúce sa starostlivosti a režimu chôdze. Úloha anaeróbov vo vývoji infekcií nôh u diabetikov bola preukázaná pred mnohými rokmi. Hlavné typy mikroorganizmov, ktoré spôsobujú tento typ infekcie, sú uvedené v tabuľke 6.

Tabuľka 6. Aeróbne a anaeróbne mikroorganizmy, ktoré spôsobujú

infekcia nôh u diabetikov

Aeróby	Anaeróby
Proteus mirabili	Bacteroides fragilis
Pseudomonas aeruginosa	iné druhy zo skupiny B. fragilis
Enterobacter aerogenes	Prevotella melaninogenica
Escherichia coli	iné druhy Prevotella\ Porphyromonas
Klebsiella pneumónia	Fusobacterium nucleatum
	iné fuzobaktérie
	Peptostreptokok
Staphylococcus aureus	iné typy klostrídií

Zistilo sa, že 18-20 % diabetických pacientov má zmiešanú aeróbnu/anaeróbnu infekciu. U jedného pacienta bolo v priemere zistených 3,2 aeróbnych a 2,6 anaeróbnych druhov mikroorganizmov, z anaeróbnych baktérií dominovali peptostreptokoky. Často boli zistené aj bakterioidy, prevotella a klostrídie. Z hlbokých rán bola asociácia baktérií izolovaná v 78 % prípadov. Gram-pozitívna aeróbna mikroflóra (stafylokoky a streptokoky) bola zistená u 25 % pacientov a gramnegatívna tyčinkovitá aeróbna mikroflóra bola zistená u približne 25 % pacientov. Asi 50 % anaeróbnych infekcií je zmiešaných. Tieto infekcie sú závažnejšie a najčastejšie vyžadujú amputáciu postihnutej končatiny.

3.3. bakteriémia a sepsa

Podiel anaeróbnych mikroorganizmov na vzniku bakteriémie sa pohybuje od 10 do 25 %. Väčšina štúdií to ukazuje AT.fragilis a iné druhy tejto skupiny, ako aj Bacteroides thetaiotaomikrón sú najčastejšou príčinou bakteriémie. Klostrídie sú ďalšie vo frekvencii (najmä Clostridium perfringens) a peptostreptokoky. Často sú izolovaní v čistej kultúre alebo v združeniach. V posledných desaťročiach došlo v mnohých krajinách sveta k zvýšeniu frekvencie anaeróbnej sepsy (z 0,67 na 1,25 prípadov na 1000 hospitalizovaných). Úmrtnosť u pacientov so sepsou spôsobenou anaeróbnymi mikroorganizmami je 38 – 50 %.

3.4. Tetanus

Tetanus je známa vážna a často smrteľná infekcia už od čias Hippokrata. Po stáročia bola táto choroba naliehavým problémom spojeným so strelnými, popáleninovými a traumatickými ranami. polemiky Clostridium tetani sa nachádzajú v ľudských a zvieracích výkaloch a sú široko distribuované v životnom prostredí. Ramon a kolegovia v roku 1927 úspešne navrhli imunizáciu toxoidom na prevenciu tetanu. Riziko vzniku tetanu je vyššie u ľudí nad 60 rokov v dôsledku zníženia účinnosti / straty ochrannej postvakcinačnej antitoxickej imunity. Terapia zahŕňa podávanie imunoglobulínov, debridement rany, antimikrobiálnu a antitoxickú terapiu, nepretržitú ošetrovateľskú starostlivosť, sedatíva a analgetiká. Mimoriadna pozornosť sa v súčasnosti venuje novorodeneckému tetanu.

3.5. Hnačka

Existuje množstvo anaeróbnych baktérií, ktoré spôsobujú hnačku. Anaerobiospirillum výrobcovia jantáru- pohyblivé špirálovité baktérie s bipolárnymi bičíkmi. Pôvodca sa vylučuje vo výkaloch psov a mačiek s asymptomatickými infekciami, ako aj od ľudí s hnačkou. Enterotoxigénne kmene AT.fragilis. V roku 1984 Mayer ukázal úlohu kmeňov produkujúcich toxíny AT.fragilis v patogenéze hnačky. Toxigénne kmene tohto patogénu sú izolované z hnačky u ľudí a zvierat. Nedajú sa odlíšiť od bežných kmeňov biochemickými a sérologickými metódami. V experimente spôsobujú hnačku a charakteristické lézie hrubého čreva a distálneho tenkého čreva s hyperpláziou krypty. Enterotoxín má molekulovú hmotnosť 19,5 kD a je termolabilný. Patogenéza, spektrum a frekvencia výskytu, ako aj optimálna terapia ešte nie sú dostatočne vyvinuté.

3.6. Chirurgická anaeróbna infekcia rán a mäkkých tkanív

Infekčné agens izolované z chirurgických rán do značnej miery závisia od typu chirurgického zákroku. Príčinou hnisania pri čistých chirurgických zákrokoch, ktoré nie sú sprevádzané otvorením gastrointestinálneho, urogenitálneho alebo dýchacieho traktu, je spravidla St. aureus. Pri iných typoch hnisania rany (čisto kontaminovaná, kontaminovaná a špinavá) sa najčastejšie izoluje zmiešaná polymikrobiálna mikroflóra chirurgicky resekovaných orgánov. V posledných rokoch sa zvyšuje úloha oportúnnej mikroflóry pri rozvoji takýchto komplikácií. Väčšina povrchových rán je diagnostikovaná neskôr medzi ôsmym a deviatym dňom po operácii. Ak sa infekcia rozvinie skôr - v priebehu prvých 48 hodín po operácii, potom je to typické pre gangrenóznu infekciu spôsobenú určitým druhom klostrídie alebo beta-hemolytického streptokoka. V týchto prípadoch dochádza k dramatickému zvýšeniu závažnosti ochorenia, výraznej toxikóze, rýchlemu lokálnemu rozvoju infekcie so zapojením všetkých vrstiev telesných tkanív do procesu.

3.7. Výroba plynu infekcia mäkkých tkanív

Prítomnosť plynu v infikovaných tkanivách je hrozivým klinickým príznakom a v minulosti túto infekciu lekári najčastejšie spájali s prítomnosťou patogénov klostridiových plynových gangrén. V súčasnosti je známe, že infekciu produkujúcu plyny u chirurgických pacientov spôsobuje zmes anaeróbnych mikroorganizmov ako napr. Clostridium, Peptostreptokok alebo Bacteroides, alebo jeden z typov aeróbnych koliformných baktérií. Predisponujúcimi faktormi pre rozvoj tejto formy infekcie sú cievne ochorenia dolných končatín, cukrovka, trauma.

3.8. Klostridiová myonekróza

Plynová gangréna je deštruktívny proces svalového tkaniva spojený s lokálnym krepitom, ťažkou systémovou intoxikáciou spôsobenou anaeróbnymi plynotvornými klostrídiami Clostridia sú grampozitívne obligátne anaeróby, ktoré sú široko rozšírené v pôde kontaminovanej živočíšnymi výlučkami. U ľudí sú normálne obyvateľmi gastrointestinálneho a ženského pohlavného traktu. Niekedy sa môžu nachádzať na koži a v ústnej dutine. Najvýznamnejším druhom zo 60 známych je Clostridium perfringens. Tento mikroorganizmus je tolerantnejší voči vzdušnému kyslíku a rýchlo rastie. Je to alfa toxín, fosfolipáza C (lecitináza), ktorá štiepi lecitín na fosforylcholín a diglyceridy, ako aj kolagenázu a proteázy, ktoré spôsobujú deštrukciu tkaniva. Produkcia alfa-toxínu je spojená s vysokou úmrtnosťou pri plynovej gangréne. Má hemolytické vlastnosti, ničí krvné doštičky, spôsobuje intenzívne poškodenie kapilár a sekundárnu deštrukciu tkaniva. V 80% prípadov je spôsobená myonekróza OD.perfringens. Okrem toho sa podieľa etiológia tohto ochorenia OD.novyi, OD. septikum, OD.bifer- mentas. Iné typy Clostridium C. histolithicum, OD.sporogenes, OD.Fallax, OD.tercium majú nízky etiologický význam.

3.9. Pomaly rastúca nekrotická infekcia rany

Agresívna život ohrozujúca infekcia rany Môže sa prejaviť až 2 týždne po infekcii, najmä u diabetických pacientov

chorý. Zvyčajne ide o zmiešané alebo monomikrobiálne fasciálne infekcie. Monomikrobiálne infekcie sú pomerne zriedkavé. v asi 10 % prípadov a zvyčajne sa pozorujú u detí. Pôvodcami sú streptokoky skupiny A, Staphylococcus aureus a anaeróbne streptokoky (Peptostreptokoky). Stafylokoky a hemolytický streptokok sa izolujú s rovnakou frekvenciou asi u 30 % pacientov. Väčšina z nich je infikovaná mimo nemocnice. Väčšina dospelých má nekrotizujúcu fascilitídu končatín (v 2/3 prípadov sú postihnuté končatiny). U detí sú častejšie postihnuté trup a slabiny. Polymikrobiálna infekcia zahŕňa množstvo procesov spôsobených anaeróbnou mikroflórou. V priemere sa od rán rozlišuje asi 5 hlavných typov. Úmrtnosť na takéto ochorenia zostáva vysoká (asi 50 % medzi pacientmi s ťažkými formami). Starší ľudia majú tendenciu mať zlú prognózu. Úmrtnosť u ľudí nad 50 rokov je viac ako 50% a u pacientov s cukrovkou - viac ako 80%.

3.10. intraperitoneálna infekcia

Najťažšie na včasnú diagnostiku a účinnú liečbu sú vnútrobrušné infekcie. Úspešný výsledok závisí predovšetkým od včasnej diagnózy, rýchlej a adekvátnej chirurgickej intervencie a použitia účinného antimikrobiálneho režimu. Polymikrobiálna povaha bakteriálnej mikroflóry, ktorá sa podieľa na vzniku zápalu pobrušnice v dôsledku perforácie pri akútnej apendicitíde, bola prvýkrát preukázaná v roku 1938 Altemeier. Počet aeróbnych a anaeróbnych mikroorganizmov izolovaných z miest intraabdominálnej sepsy závisí od charakteru mikroflóry alebo poraneného orgánu. Zovšeobecnené údaje naznačujú, že priemerný počet bakteriálnych druhov izolovaných z ohniska infekcie sa pohybuje od 2,5 do 5. Pre aeróbne mikroorganizmy sú tieto údaje 1,4 – 2,0 druhov a 2,4 – 3,0 druhov anaeróbnych mikroorganizmov. Aspoň 1 typ anaeróbov sa zistí u 65-94% pacientov. Z aeróbnych mikroorganizmov sa najčastejšie zisťujú Escherichia coli, Klebsiella, Streptococcus, Proteus, Enterobacter a z anaeróbnych mikroorganizmov - Bacteroides, Peptostreptococci, Clostridia. Bakteroidy tvoria 30 % až 60 % všetkých izolovaných kmeňov anaeróbnych mikroorganizmov. Podľa výsledkov mnohých štúdií je 15 % infekcií spôsobených anaeróbnou a 10 % aeróbnou mikroflórou, a teda 75 % je spôsobených asociáciami. Najvýznamnejší z nich - E.coli a AT.fragilis. Podľa N. S. Bogomolovej a L. V. Bolshakova (1996) anaeróbna infekcia

bola príčinou rozvoja odontogénnych ochorení v 72,2 % prípadov, zápal pobrušnice - v 62,92 % prípadov, zápal pobrušnice v dôsledku gynekologických ochorení - u 45,45 % pacientov, cholangitída - v 70,2 %. Anaeróbna mikroflóra bola najčastejšie izolovaná pri ťažkej peritonitíde v toxickom a terminálnom štádiu ochorenia.

3.11. Charakterizácia experimentálnych anaeróbnych abscesov

V experimente AT.fragilis iniciuje rozvoj subkutánneho abscesu. Počiatočnými udalosťami sú migrácia polymorfonukleárnych leukocytov a rozvoj edému tkaniva. Po 6 dňoch sú jasne identifikované 3 zóny: vnútorná - pozostáva z nekrotických hmôt a degeneratívne zmenených zápalových buniek a baktérií; stredná je vytvorená z leukocytovej šachty a vonkajšia zóna je reprezentovaná vrstvou kolagénu a vláknitého tkaniva. Koncentrácia baktérií sa pohybuje od 10 8 do 10 9 v 1 ml hnisu. Absces je charakterizovaný nízkym redoxným potenciálom. Je veľmi ťažké liečiť, pretože dochádza k deštrukcii antimikrobiálnych liekov baktériami, ako aj k úniku z obranných faktorov hostiteľa.

3.12. Pseudomembranózna kolitída

Pseudomembranózna kolitída (PMC) je závažné gastrointestinálne ochorenie charakterizované exsudatívnymi plakmi na sliznici hrubého čreva. Táto choroba bola prvýkrát popísaná v roku 1893, dlho pred príchodom antimikrobiálnych látok a ich použitia na liečebné účely. Teraz sa zistilo, že etiologickým faktorom tohto ochorenia je Clostridium ťažkopádne. Porušenie mikroekológie čreva v dôsledku užívania antibiotík je príčinou rozvoja MVP a širokého šírenia infekcií spôsobených OD.ťažkopádne, klinické spektrum prejavov sa značne líši - od nosičstva a krátkodobej, spontánne prechádzajúcej hnačky až po rozvoj MVP. Počet pacientov s kolitídou spôsobenou C. ťažkopádne, medzi ambulantnými pacientmi 1-3 zo 100 000 a medzi hospitalizovanými pacientmi 1 zo 100-1000.

Patogenéza. Kolonizácia ľudského čreva toxigénnymi kmeňmi OD,ťažkopádne je dôležitým faktorom vo vývoji PMC. Asymptomatické prenášanie sa však vyskytuje približne u 3 – 6 % dospelých a 14 – 15 % detí. Normálna črevná mikroflóra slúži ako spoľahlivá bariéra pre kolonizáciu patogénnymi mikroorganizmami. Je ľahko narušený antibiotikami a veľmi ťažko sa zotavuje. Najvýraznejší účinok na anaeróbnu mikroflóru majú cefalosporíny 3. generácie, klindamycín (skupina linkomycínu) a ampicilín. Spravidla všetci pacienti s MVP trpia hnačkou. Zároveň je stolica tekutá s nečistotami krvi a hlienu. Existuje hyperémia a opuch črevnej sliznice. Často sa zaznamenáva ulcerózna kolitída alebo proktitída, ktorá sa vyznačuje granuláciami, hemoragickou sliznicou. Väčšina pacientov s týmto ochorením má horúčku, leukocytózu a napätie v bruchu. Následne sa môžu vyvinúť závažné komplikácie vrátane celkovej a lokálnej intoxikácie, hypoalbuminémie. Príznaky hnačky súvisiacej s antibiotikami začínajú na 4. až 5. deň antibiotickej liečby. V stolici takýchto pacientov S. ťažkopádne v 94% prípadov, zatiaľ čo u zdravých dospelých je tento mikroorganizmus izolovaný len v 0,3% prípadov.

OD.ťažkopádne produkuje dva typy vysoko aktívnych exotoxínov – A a B. Toxín ​​A je enterotoxín, ktorý spôsobuje hypersekréciu a hromadenie tekutiny v čreve, ako aj zápalovú reakciu s hemoragickým syndrómom. Toxín ​​B je cytotoxín. Neutralizuje ho polyvalentné antigangrénové sérum. Tento cytotoxín sa nachádza približne u 50 % pacientov s kolitídou spojenou s antibiotikami bez pseudomembranóznej tvorby a u 15 % pacientov s hnačkou spojenou s antibiotikami s normálnym nálezom pri sigmoidoskopii. Jeho cytotoxické pôsobenie je založené na depolymerizácii mikrofilamentového aktínu a poškodení cytoskeletu enterocytov. V poslednej dobe sa čoraz viac údajov objavuje na OD.ťažkopádne ako nozokomiálny infekčný agens. V tomto ohľade je žiaduce izolovať chirurgických pacientov, nosičov tohto mikroorganizmu, aby sa zabránilo šíreniu infekcie v nemocnici. OD.ťažkopádne najcitlivejšie na vankomycín, metronidazol a bacitracín. Tieto pozorovania teda potvrdzujú, že kmene produkujúce toxíny OD.ťažkopádne spôsobujú široké spektrum ochorení, vrátane hnačky, kolitídy a MVP.

3.13. Pôrodnícko-gynekologické infekcie

Pochopenie zákonitostí vývoja infekcií ženských pohlavných orgánov je možné na základe hĺbkovej štúdie mikrobiocenózy vagíny. Na normálnu mikroflóru vagíny treba myslieť z hľadiska ochrannej bariéry proti najbežnejším patogénom.

Dysbiotické procesy prispievajú k vzniku bakteriálnej vaginózy (BV). BV je spojená s rozvojom takých komplikácií, ako sú anaeróbne pooperačné infekcie mäkkých tkanív, popôrodná a postabortívna endometritída, predčasný potrat, intraamniotická infekcia (10). Pôrodnícko-gynekologická infekcia je polymikrobiálnej povahy. V prvom rade by som chcel upozorniť na rastúcu úlohu anaeróbov pri rozvoji akútnych zápalových procesov panvových orgánov - akútny zápal príveskov maternice, popôrodná endometritída, najmä po operačnom pôrode, pooperačné komplikácie v gynekológii (perikulitída, abscesy, infekcia rany) (5). Medzi mikroorganizmy najčastejšie izolované z infekcií ženského pohlavného traktu patria Bactemidy fragilis, ako aj typy Peptokok a Peptostreptokok. Streptokoky skupiny A sa bežne nevyskytujú pri infekciách panvy. Streptokoky skupiny B často spôsobujú sepsu u pôrodných pacientok, ktorých vstupnou bránou je pohlavný trakt. V posledných rokoch sa s pôrodnými a gynekologickými infekciami prideľuje stále viac OD.trachomatis. Medzi najčastejšie infekčné procesy urogenitálneho traktu patrí pelvioperitonitída, endometritída po cisárskom reze, infekcie vaginálnej manžety po hysterektómii, infekcie panvy po septickom potrate. Účinnosť klindamycínu pri týchto infekciách sa pohybuje od 87 % do 100 % (10).

3.14. Anaeróbna infekcia u pacientov s rakovinou

Riziko infekcie u onkologických pacientov je neporovnateľne vyššie ako u iných chirurgických pacientov. Táto vlastnosť je vysvetlená množstvom faktorov - závažnosť základného ochorenia, imunodeficiencia, veľké množstvo invazívnych diagnostických a terapeutických postupov, veľký objem a traumatizmus chirurgických zákrokov, použitie veľmi agresívnych metód liečby - rádio a chemoterapia . U pacientov operovaných pre nádory tráviaceho traktu vznikajú v pooperačnom období subdiafragmatické, subhepatálne a intraperitoneálne abscesy anaeróbnej etiológie. Dominantné patogény Bacteroides fragi- lis, Prevotella spp.. Fusobacterium spp., grampozitívne koky. V posledných rokoch sa čoraz častejšie objavujú správy o významnej úlohe nesporogénnych anaeróbov pri vzniku septických stavov a o ich izolácii z krvi pri bakteriémii (3).

4. Laboratórna diagnostika

4.1. Študovaný materiál

Laboratórna diagnostika anaeróbnej infekcie je pomerne náročná úloha. Čas štúdie od okamihu doručenia patologického materiálu z kliniky do mikrobiologického laboratória až do získania úplnej podrobnej odpovede je od 7 do 10 dní, čo nemôže uspokojiť lekárov. Výsledok bakteriologickej analýzy je často známy v čase, keď je pacient prepustený. Na začiatok by sa mala zodpovedať otázka: sú v materiáli prítomné anaeróby. Je dôležité mať na pamäti, že anaeróby sú hlavnou zložkou lokálnej mikroflóry kože a slizníc a navyše, ich izolácia a identifikácia sa musia vykonávať za vhodných podmienok. Úspešný začiatok výskumu v klinickej mikrobiológii anaeróbnej infekcie závisí od správneho odberu vhodného klinického materiálu.

V bežnej laboratórnej praxi sa najčastejšie používajú tieto materiály: 1) infikované lézie z gastrointestinálneho traktu alebo ženského pohlavného traktu; 2) materiál z brušnej dutiny s peritonitídou a abscesmi; 3) krv od septických pacientov; 4) výtok pri chronických zápalových ochoreniach dýchacích ciest (sinusitída, zápal stredného ucha, mastoiditída); 5) materiál z dolných častí dýchacieho traktu v prípade aspiračnej pneumónie; 6) cerebrospinálna tekutina pri meningitíde; 7) obsah mozgového abscesu; 8) lokálny materiál pre zubné choroby; 9) obsahy povrchových abscesov: 10) obsahy povrchových rán; 11) materiál infikovaných rán (chirurgických a traumatických); 12) biopsie (19, 21, 29, 31, 32, 36, 38).

4.2. Etapy materiálového výskumu v laboratóriu

Úspešná diagnostika a liečba anaeróbnej infekcie je možná len so zainteresovanou spoluprácou mikrobiológov a klinických lekárov príslušného profilu. Získanie adekvátnych vzoriek na mikrobiologické testovanie je kritické. Metódy odberu materiálu závisia od miesta a typu patologického procesu. Laboratórny výskum je založený na indikácii a následnej druhovej identifikácii anaeróbnych a aeróbnych mikroorganizmov obsiahnutých v testovanom materiáli tradičnými a expresnými metódami, ako aj na stanovení citlivosti izolovaných mikroorganizmov na antimikrobiálne chemoterapeutiká (2).

4.3. Priama skúška materiálu

Existuje mnoho rýchlych priamych testov, ktoré silne naznačujú prítomnosť anaeróbov vo veľkom počte v testovanom materiáli. Niektoré z nich sú celkom jednoduché a lacné, a preto majú výhody oproti mnohým drahým laboratórnym testom.

1. 3 a p a x. Fetidné materiály vždy obsahujú anaeróby, len niektoré z nich sú bez zápachu.

2. Plynová kvapalinová chromatografia (GLC). Vzťahuje sa na počet expresných diagnostických metód. GLC umožňuje určiť v hnise mastné kyseliny s krátkym reťazcom (octová, propiónová, izovalerová, izokaprónová, kaprónová), ktoré spôsobujú zápach. Pomocou GLC je možné podľa spektra prchavých mastných kyselín uskutočniť druhovú identifikáciu v ňom prítomných mikroorganizmov.

3. Fluorescencia. Štúdium materiálov (hnis, tkanivá) v ultrafialovom svetle pri vlnovej dĺžke 365 nm odhaľuje intenzívnu červenú fluorescenciu, ktorá sa vysvetľuje prítomnosťou čiernych pigmentovaných baktérií patriacich do skupín Basteroides a Porphyromonas, a ktorá poukazuje na prítomnosť anaeróbov.

4. Bakterioskopia. Pri štúdiu mnohých preparátov farbených Gramovou metódou sa v nátere zistí prítomnosť buniek zápalového ložiska, mikroorganizmov, najmä polymorfných gramnegatívnych tyčiniek, malých grampozitívnych kokov alebo grampozitívnych bacilov.

5. Imunofluorescencia. Priama a nepriama imunofluorescencia sú expresné metódy a umožňujú detekovať anaeróbne mikroorganizmy v testovanom materiáli.

6. Metóda ELISA. ELISA umožňuje určiť prítomnosť štruktúrnych antigénov alebo exotoxínov anaeróbnych mikroorganizmov.

7. Molekulárne biologické metódy. Najväčšiu distribúciu, citlivosť a špecifickosť v posledných rokoch vykazuje polymerázová reťazová reakcia (CPR). Používa sa ako na detekciu baktérií priamo v materiáli, tak aj na identifikáciu.

4.4. Metódy a systémy vytvárania anaeróbnych podmienok

Materiál odobratý z vhodných zdrojov a vo vhodných nádobách alebo transportnom médiu na tento účel by mal byť okamžite doručený do laboratória. Existujú však dôkazy, že klinicky významné anaeróby vo veľkých objemoch hnisu alebo v anaeróbnom transportnom médiu prežívajú 24 hodín. Je dôležité, aby sa naočkované médium inkubovalo za anaeróbnych podmienok alebo sa umiestnilo do nádoby naplnenej CO2 a skladovalo sa, kým sa neprenesie do špeciálneho inkubačného systému. V klinických laboratóriách sa bežne používajú tri typy anaeróbnych systémov. Viac používanými systémami sú mikroanaerostaty typu (GasPark, BBL, Cockeysville), ktoré sa v laboratóriách používajú už mnoho rokov, najmä v malých laboratóriách, a poskytujú uspokojivé výsledky. Petriho misky s očkovaním anaeróbnymi baktériami sú umiestnené vo vnútri nádoby súčasne so špeciálnym plynotvorným vakom a indikátorom. Do vrecka sa pridá voda, nádoba sa hermeticky uzavrie, z vrecka sa za prítomnosti katalyzátora (zvyčajne paládium) uvoľní CO2 a H2. V prítomnosti katalyzátora H2 reaguje s O2 za vzniku vody. CO2 je nevyhnutný pre rast anaeróbov, keďže sú to kapnofily. Ako indikátor anaeróbnych podmienok sa pridáva metylénová modrá. Ak systém generujúci plyn a katalyzátor fungujú efektívne, indikátor zmení farbu. Väčšina anaeróbov vyžaduje najmenej 48 hodín kultivácie. Potom sa komora otvorí a poháre sa prvýkrát preskúmajú, čo nie je príliš vhodné, pretože anaeróby sú citlivé na kyslík a rýchlo strácajú svoju životaschopnosť.

V poslednej dobe prichádzajú do praxe jednoduchšie anaeróbne systémy – anaeróbne vaky. Jedna alebo dve osadené misky s plynotvorným vreckom sa umiestnia do priehľadného, ​​hermeticky uzavretého polyetylénového vrecka a inkubujú sa za termostatických podmienok. Priehľadnosť polyetylénových vrecúšok umožňuje jednoduché pravidelné monitorovanie rastu mikroorganizmov.

Tretím systémom na kultiváciu anaeróbnych mikroorganizmov je automaticky utesnená komora so sklenenou prednou stenou (anaeróbna stanica) s gumenými rukavicami a automatickým prívodom bezkyslíkatej zmesi plynov (N2, H2, CO2). Materiály, poháre, skúmavky, tablety na biochemickú identifikáciu a citlivosť na antibiotiká budú umiestnené do tejto skrinky cez špeciálny poklop. Všetky manipulácie vykonáva bakteriológ v gumených rukaviciach. Materiál a misky v tomto systéme je možné prezerať denne a plodiny je možné inkubovať od 7 do 10 dní.

Tieto tri systémy majú svoje výhody a nevýhody, ale sú účinné na izoláciu anaeróbov a mali by byť v každom bakteriologickom laboratóriu. Často sa používajú súčasne, aj keď najväčšiu spoľahlivosť má spôsob kultivácie v anaeróbnej stanici.

4.5. Živné médiá a pestovanie

Štúdium anaeróbnych mikroorganizmov sa uskutočňuje v niekoľkých etapách. Všeobecná schéma izolácie a identifikácie anaeróbov je znázornená na obrázku 1.

Dôležitým faktorom vo vývoji anaeróbnej bakteriológie je dostupnosť zbierky typických bakteriálnych kmeňov, vrátane referenčných kmeňov z kolekcií ATCC, CDC a VPI. Toto je obzvlášť dôležité pre monitorovanie živných médií, pre biochemickú identifikáciu čistých kultúr a pre hodnotenie aktivity antibakteriálnych liečiv. Existuje široká škála základných médií, ktoré sa používajú na prípravu špeciálnych anaeróbnych kultivačných médií.

Živné pôdy pre anaeróby musia spĺňať tieto základné požiadavky: 1) spĺňať nutričné ​​potreby; 2) zabezpečiť rýchly rast mikroorganizmov; 3) primerane znížiť. Primárna inokulácia materiálu sa uskutočňuje na platniach s krvným agarom alebo voliteľných médiách uvedených v tabuľke 7.

Čoraz častejšie sa izolácia obligátnych anaeróbov z klinického materiálu vykonáva na médiách, ktoré obsahujú selektívne činidlá v určitej koncentrácii, čo umožňuje izoláciu určitých skupín anaeróbov (20, 23) (tabuľka 8).

Trvanie inkubácie a frekvencia skúmania naočkovaných misiek závisí od testovaného materiálu a zloženia mikroflóry (tabuľka 9).

Študovaný materiál odnímateľné rany, obsah abscesu, Tracheobronchonálny aspirát atď. Transport do laboratória: v cyprušte, v špeciálnom transportnom médiu (okamžité umiestnenie materiálu do média) Materiálová mikroskopia Gramovo farbenie

Kultivácia a izolácia čistá kultúra Aeróbne poháre pre 35±2°C v porovnaní s 18-28 hodín anaeróbov 5-10% С0 2 1. krvný agar mikroaerostat Gaz-Pak (H2 + C02) 35 ± 2 °C od 48 hodín do 7 dní 2. Schaedlerov krvný agar 35 ± 2 °C od 48 hodín do 7 dní 3. Selektívne médium na identifikáciu anaeróbov od 48 hodín do 2 týždňov 4. Kvapalné médium (tioglykol)

Identifikácia.Čisté kultúry z izolovaných kolónií 1. Farbenie podľa Grama a Orzeszka na zistenie spór 2. Morfológia kolónií 3. Vzťah typu kolónie s kyslíkom 4. Predbežná diferenciácia podľa citlivosti na antimikrobiálne lieky 5.Biochemické testy Stanovenie citlivosti na antibiotiká 1. Spôsob riedenia v agare alebo bujóne 2. Metóda papierového disku (difúzia)

Ryža. 1. Izolácia a identifikácia anaeróbnych mikroorganizmov

anaeróbne mikroorganizmy

streda	Účel
Krvný agar Brucella (CDC anaeróbny krvný agar, Shadlerov krvný agar) (BRU agar)	Neselektívne, na izoláciu anaeróbov prítomných v materiáli
Žlčový eskulínový agar pre baktérie(WWE agar)	Selektívne a diferenciálne; na izoláciu baktérií skupiny Bacteroides fragilis
Krvný agar kanamycín-vankomycín(KVLB)	Selektívne pre väčšinu netvoriacich spóry Gramnegatívne baktérie
Fenyl Ethyl Agar(PEA)	Inhibuje rast Proteus a iných enterobaktérií; stimuluje rast gram-pozitívnych a gram-negatívnych anaeróbov
Tioglykolový vývar(THIO)	Pre špeciálne situácie
Žĺtkový agar(EYA)	Na izoláciu klostrídií
Cykloserín-cefoxitín-fruktózový agar(CCFA) alebo cykloserínmanitový agar (CMA) alebo cykloserínmanitový krvný agar (CMBA)	Selektívne pre C. difficile
Kryštálovo-fialovo-erytromycín-nový agar(CVEB)	Na izoláciu Fusobacterium nucleatum a Leptotrichia buccalis
Bakteroidný gingivalis agar(BGA)	Na izoláciu Porphyromonas gingivalis

Tabuľka 8. Selektívne činidlá pre obligátne anaeróby

organizmov	Selektívne činidlá
Povinné anaeróby z klinického materiálu	neomycín (70 mg/l) kyselina nalidixová (10 mg/l)
Actinomyces spp.	metronidazol (5 mg/l)
Bacteroides spp. Fusobacterium spp.	kyselina nalidixová (10 mg/l) + vankomycín (2,5 mg/l)
Bacteroides urealytica	kyselina nalidixová (10 mg/l) teikoplanín (20 mg/l)
Clostridium difficile	cykloserín (250 mg/l) cefoxitín (8 mg/l)
Fusobacterium	rifampicín (50 mg/l) neomycín (100 mg/l) vankomycín (5 mg/l)

Zúčtovanie výsledkov sa uskutočňuje opisom kultúrnych vlastností pestovaných mikroorganizmov, pigmentácie kolónií, fluorescencie, hemolýzy. Potom sa z kolónií pripraví náter, zafarbí sa gramom, a tak sa zistia gramnegatívne a grampozitívne baktérie, popíšu sa mikroskopické a morfologické vlastnosti. Následne sa mikroorganizmy každého typu kolónií subkultivujú a kultivujú v tioglykolovom bujóne s prídavkom hemínu a vitamínu K. Morfológia kolónií, prítomnosť pigmentu, hemolytické vlastnosti a charakteristiky baktérií v Gramovom farbení umožňujú predbežne identifikovať a odlíšiť anaeróby. V dôsledku toho možno všetky anaeróbne mikroorganizmy rozdeliť do 4 skupín: 1) Gr + koky; 2) Gr+ bacily alebo kokobacily: 3) Gr- cocci; 4) Gr-bacily alebo kokobacily (20, 22, 32).

Tabuľka 9. Trvanie inkubácie a frekvencia štúdie

kultúry anaeróbnych baktérií

Druh plodín	Inkubačný čas*	Frekvencia štúdia
Krv		Denne do 7. a po 14. hod
Kvapaliny		Denne
Abscesy, rany		Denne
Dýchacie cesty Spútum Transtracheálny aspirát Bronchiálny výtok		Denne raz Denne Denne
Urogenitálny trakt Vagína, maternica Prostata		Denne Denne Denne raz
Výkaly		Denne
Anaeróby Brucella aktinomycéty		Denne 3 krát týždenne 1 krát za týždeň

* kým sa nedosiahne negatívny výsledok

V tretej fáze výskumu sa vykonáva dlhšia identifikácia. Konečná identifikácia je založená na stanovení biochemických vlastností, fyziologických a genetických charakteristík, faktorov patogenity v teste neutralizácie toxínov. Hoci úplnosť identifikácie anaeróbov sa môže značne líšiť, niektoré jednoduché testy s vysokou pravdepodobnosťou umožňujú identifikáciu čistých kultúr anaeróbnych baktérií – Gramovo farbenie, pohyblivosť, citlivosť na niektoré antibiotiká pomocou papierových diskov a biochemické vlastnosti.

5. Antibakteriálna liečba anaeróbnej infekcie

Kmene mikroorganizmov rezistentných na antibiotiká vznikli a začali sa šíriť ihneď po rozšírenom zavedení antibiotík do klinickej praxe. Mechanizmy vzniku rezistencie mikroorganizmov na antibiotiká sú zložité a rôznorodé. Delia sa na primárne a získané. Získaná odolnosť sa vytvára pod vplyvom drog. Hlavné spôsoby jeho vzniku sú nasledovné: a) inaktivácia a modifikácia liečiva enzýmovými systémami baktérií a jeho prechod na neaktívnu formu; b) zníženie permeability povrchových štruktúr bakteriálnej bunky; c) porušenie mechanizmov transportu do bunky; d) zmena funkčného významu cieľa pre liečivo. Mechanizmy získanej rezistencie mikroorganizmov sú spojené so zmenami na genetickej úrovni: 1) mutácie; 2) genetické rekombinácie. Mimoriadne významnú úlohu zohrávajú mechanizmy intra- a interšpecifického prenosu extrachromozomálnych faktorov dedičnosti - plazmidov a transpozónov, ktoré riadia rezistenciu mikroorganizmov na antibiotiká a iné chemoterapeutiká (13, 20, 23, 33, 39). Informácie o rezistencii anaeróbnych mikroorganizmov na antibiotiká boli získané z epidemiologických a genetických/molekulárnych štúdií. Epidemiologické údaje naznačujú, že približne od roku 1977 došlo k zvýšeniu rezistencie anaeróbnych baktérií na viaceré antibiotiká: tetracyklín, erytromycín, penicilín, ampicilín, amoxicilín, tikarcilín, imipeném, metronidazol, chloramfenikol atď. Približne 50 % baktoteroidov je rezistentných na penicilín G a tetracyklín.

Pri predpisovaní antibiotickej terapie pri zmiešanej aeróbno-anaeróbnej infekcii je potrebné zodpovedať si niekoľko otázok: a) kde je infekcia lokalizovaná?; b) aké mikroorganizmy najčastejšie spôsobujú infekcie v tejto oblasti?; c) aká je závažnosť ochorenia?; d) aké sú klinické indikácie na použitie antibiotík?; e) aká je bezpečnosť používania tohto antibiotika?; e) aké sú jej náklady?; g) aké sú jeho antibakteriálne vlastnosti?; h) aké je priemerné trvanie užívania drogy na dosiahnutie vyliečenia?; i) prechádza hematoencefalickou bariérou?; j) ako to ovplyvňuje normálnu mikroflóru?; k) Sú na liečbu tohto procesu potrebné ďalšie antimikrobiálne látky?

5.1. Charakteristika hlavných antimikrobiálnych látok používaných pri liečbe anaeróbnej infekcie

P e n i c i l l i n s. Historicky bol penicilín G široko používaný na liečbu zmiešaných infekcií. Anaeróby, najmä baktérie skupiny Bacteroides fragilis, však majú schopnosť produkovať beta-laktamázu a ničiť penicilín, čo znižuje jeho terapeutickú účinnosť. Má nízku až strednú toxicitu, malý účinok na normálnu mikroflóru, ale má malú aktivitu proti anaeróbom produkujúcim beta-laktamázu a je obmedzený proti aeróbnym mikroorganizmom. Polosyntetické penicilíny (naflacín, oxacilín, kloxacilín a dikloxacilín) sú menej aktívne a na liečbu anaeróbnych infekcií nepostačujú. Porovnávacia randomizovaná štúdia klinickej účinnosti penicilínu a klindamycínu pri liečbe pľúcnych abscesov ukázala, že použitie klindamycínu u pacientov znížilo obdobie horúčky a tvorby spúta na 4,4 oproti 7,6 dňom a na 4,2 oproti 8 dňom, v uvedenom poradí. V priemere sa vyliečilo 8 (53 %) z 15 pacientov liečených penicilínom, zatiaľ čo všetkých 13 pacientov (100 %) liečených klindamycínom sa vyliečilo. Klindamycín je pri liečbe pacientov s anaeróbnym pľúcnym abscesom účinnejší ako penicilín. V priemere bola účinnosť penicilínu asi 50-55% a klindamycínu - 94-95%. Zároveň bola v materiáli zaznamenaná prítomnosť mikroorganizmov rezistentných na penicilín, čo spôsobilo častý dôvod neúčinnosti penicilínu a zároveň ukázalo, že klindamycín je liekom voľby na začiatku liečby.

T e tra c a c lin y. Tetracyklíny sa vyznačujú aj nízkou

ktorá toxicita a minimálny vplyv na normálnu mikroflóru. Tetracyklíny boli tiež liekmi prvej voľby, pretože takmer všetky anaeróby boli na ne citlivé, ale od roku 1955 sa zvýšila rezistencia voči nim. Doxycyklín a monocyklín sú z nich aktívnejšie, ale značný počet anaeróbov je voči nim tiež odolný.

Chl o r a m f e n i k o l. Chloramfenikol má významný vplyv na normálnu mikroflóru. Tento liek je mimoriadne účinný proti baktériám skupiny B. fragilis, dobre preniká do telesných tekutín a tkanív a má priemernú aktivitu proti iným anaeróbom. V tomto ohľade sa používa ako liek voľby na liečbu život ohrozujúcich chorôb, najmä tých, ktoré postihujú centrálny nervový systém, pretože ľahko preniká cez hematoencefalickú bariéru. Bohužiaľ, chloramfenikol má množstvo nevýhod (inhibícia hematopoézy v závislosti od dávky). Okrem toho môže spôsobiť idiosenkratickú aplastickú anémiu nezávislú od dávky. Niektoré kmene C. perfringens a B. fragilis sú schopné redukovať p-nitroskupinu chloramfenikolu a selektívne ju inaktivovať. Niektoré kmene B. fragilis sú vysoko odolné voči chloramfenikolu, pretože produkujú acetyltransferázu. V súčasnosti sa používanie chloramfenikolu na liečbu anaeróbnych infekcií výrazne znížilo jednak z dôvodu strachu z rozvinutia vedľajších hematologických účinkov a jednak z dôvodu objavenia sa mnohých nových účinných liekov.

K l i n d a m i c i n. Klindamycín je 7(S)-chlór-7-deoxyderivát linkomycínu. Chemická modifikácia molekuly linkomycínu priniesla niekoľko výhod: lepšia absorpcia z gastrointestinálneho traktu, osemnásobné zvýšenie aktivity proti aeróbnym grampozitívnym kokom, rozšírenie spektra aktivity proti mnohým grampozitívnym a gramnegatívnym anaeróbnym baktériám, ako napr. ako aj prvoky (Toxoplasma a Plasmodium). Terapeutické indikácie na použitie klindamycínu sú pomerne široké (tabuľka 10).

Gram-pozitívne baktérie. Rast viac ako 90 % kmeňov S. aureus je inhibovaný v prítomnosti klindamycínu v koncentrácii 0,1 ug/ml. V koncentráciách, ktoré možno ľahko dosiahnuť v sére, je klindamycín účinný proti Str. pyogenes, Str. zápal pľúc, Str. viridans. Väčšina kmeňov difterických bacilov je tiež citlivá na klindamycín. S ohľadom na gramnegatívne aeróbne baktérie Klebsiella, Escherichia coli, Proteus, Enterobacter, Shigella, Serratia, Pseudomonas je toto antibiotikum neaktívne. Gram-pozitívne anaeróbne koky, vrátane všetkých typov peptokokov, peptostreptokokov, ako aj propionobaktérií, bifidumbaktérií a laktobacilov, sú vo všeobecnosti vysoko citlivé na klindamycín. Citlivé sú naň aj klinicky významné klostrídie - C. perfringens, C. tetani, ako aj iné klostrídie, často sa vyskytujúce pri intraperitoneálnych a panvových infekciách.

Tabuľka 10. Indikácie pre použitie klindamycínu

Biotop	Choroba
horné dýchacie cesty	Tonzilitída, faryngitída, sinusitída, zápal stredného ucha, šarlach
dolných dýchacích ciest	Bronchitída, pneumónia, empyém, pľúcny absces
Koža a mäkké tkanivo	Pyodermia, vriedky, celulitída, impetigo, abscesy, rany
Kosti a kĺby	Osteomyelitída, septická artritída
Panvové orgány	Endometritída, celulitída, infekcie vaginálnej manžety, tuboovariálne abscesy
Ústna dutina	periodontálny absces, paradentóza
Septikémia, endokarditída

Gramnegatívne anaeróby – bakteroidy, fusobaktérie a veillonella – sú vysoko citlivé na klindamycín. Je dobre distribuovaný v mnohých tkanivách a biologických tekutinách, takže vo väčšine z nich sa dosahujú významné terapeutické koncentrácie, ale nepreniká hematoencefalickou bariérou. Zvlášť zaujímavé sú koncentrácie liečiva v mandlích, pľúcnom tkanive, slepom čreve, vajíčkovodoch, svaloch, koži, kostiach, synoviálnej tekutine. Klindamycín sa koncentruje v neutrofiloch a makrofágoch. Alveolárne makrofágy koncentrujú klindamycín intracelulárne (30 minút po podaní koncentrácia prevyšuje extracelulárnu koncentráciu 50-krát). Zvyšuje fagocytárnu aktivitu neutrofilov a makrofágov, stimuluje chemotaxiu, inhibuje produkciu určitých bakteriálnych toxínov.

M e t r o n i d a z o l. Tento chemoterapeutický liek sa vyznačuje veľmi nízkou toxicitou, je baktericídny proti anaeróbom a nie je inaktivovaný bakterioidnými beta-laktamázami. Bakteroidy sú na ňu vysoko citlivé, ale niektoré anaeróbne koky a anaeróbne grampozitívne bacily môžu byť rezistentné. Metronidazol je neaktívny proti aeróbnej mikroflóre a pri liečbe vnútrobrušnej sepsy sa musí kombinovať s gentamicínom alebo niektorými aminoglykozidmi. Môže spôsobiť prechodnú neutropéniu. Kombinácie metronidazol-gentamicín a klindamycín-gentamycín sa nelíšia v účinnosti pri liečbe závažných intraabdominálnych infekcií.

C e f o k s i t a n. Toto antibiotikum patrí medzi cefalosporíny, má nízku a strednú toxicitu a spravidla nie je inaktivované bakterioidnou beta-laktamázou. Hoci existujú správy o prípadoch izolácie rezistentných kmeňov anaeróbnych baktérií v dôsledku prítomnosti proteínov viažucich antibiotikum, ktoré znižujú transport lieku do bakteriálnej bunky. Odolnosť baktérií B. fragilis voči cefoxitínu sa pohybuje od 2 do 13 %. Odporúča sa na liečbu stredne ťažkých brušných infekcií.

C e f o t e t a n. Tento liek je účinnejší proti gramnegatívnym anaeróbnym mikroorganizmom v porovnaní s cefoxitínom. Zistilo sa však, že približne 8 % až 25 % kmeňov B. fragilis je voči nej rezistentných. Je účinný pri liečbe gynekologických a brušných infekcií (abscesy, apendicitída).

C e f met a z o l. V spektre je podobný cefoxitínu a cefotetanu (aktívnejší ako cefoxitín, ale menej aktívny ako cefotetan). Môže sa použiť na liečbu miernych až stredne závažných infekcií.

C e f a pera z o n. Vyznačuje sa nízkou toxicitou, vyššou aktivitou v porovnaní s vyššie uvedenými tromi liekmi, ale bolo naň identifikovaných 15 až 28 % rezistentných kmeňov anaeróbnych baktérií. Je jasné, že to nie je liek voľby na liečbu anaeróbnej infekcie.

C e f t i z o k c i m. Je to bezpečný a účinný liek pri liečbe infekcií nôh u pacientov s cukrovkou, traumatickou peritonitídou, apendicitídou.

M e r o p e n e m. Meropenem, nový karbapeném metylovaný v polohe 1, je odolný voči pôsobeniu renálnej dehydrogenázy 1, ktorá ho degraduje. Je asi 2-4 krát aktívnejší ako imipeném proti aeróbnym gramnegatívnym organizmom, vrátane zástupcov enterobaktérií, hemofilov, pseudomonas, neisserií, ale má o niečo menšiu aktivitu proti stafylokokom, niektorým streptokokom a enterokokom. Jeho aktivita proti grampozitívnym anaeróbnym baktériám je podobná ako u imipenému.

5.2. Kombinácie beta-laktámových liekov a inhibítorov beta-laktamázy

Vývoj inhibítorov beta-laktamáz (klavulanát, sulbaktám, tazobaktám) je perspektívny smer a umožňuje použitie nových beta-laktámových látok chránených pred hydrolýzou pri ich súčasnom podávaní: a) amoxicilín - kyselina klavulanová - má väčšie spektrum antimikrobiálnej aktivity ako samotný amoxicilín a svojou účinnosťou sa blíži ku kombinácii antibiotík – penicilín-kloxacilín; b) kyselina tikarcilín-klavulánová – rozširuje spektrum antimikrobiálnej aktivity antibiotika proti baktériám produkujúcim beta-lakgamázu, ako sú stafylokoky, hemofilus, klebsiella a anaeróby vrátane bakteroidov. Minimálna inhibičná koncentrácia tejto zmesi bola 16-krát nižšia ako koncentrácia tikarcilínu; c) ampicilín-sulbaktám - pri kombinácii v pomere 1: 2 sa ich spektrum výrazne rozširuje a zahŕňa stafylokoky, hemofily, klebsiellu a väčšinu anaeróbnych baktérií. Len 1 % bakteroidov je odolných voči tejto kombinácii; d) cefaperazón-sulbaktám - v pomere 1:2 tiež výrazne rozširuje spektrum antibakteriálnej aktivity; e) piperacilín-tazobaktám. Tazobaktám je nový beta-laktámový inhibítor, ktorý pôsobí na mnohé beta-laktamázy. Je stabilnejšia ako kyselina klavulanová. Túto kombináciu možno považovať za liek na empirickú monoterapiu ťažkých polymikrobiálnych infekcií, ako sú pneumónia, intraabdominálna sepsa, nekrotizujúca infekcia mäkkých tkanív, gynekologické infekcie; f) imipeném-cilastatín - imipeném je členom novej triedy antibiotík známych ako karbapenémy. Používa sa v kombinácii s cilastatínom v pomere 1:1. Ich účinnosť je podobná klindamycín-aminoglykozidom pri liečbe zmiešaných anaeróbnych chirurgických infekcií.

5.3. Klinický význam stanovenia citlivosti anaeróbnych mikroorganizmov na antimikrobiálne lieky

Rastúca rezistencia mnohých anaeróbnych baktérií na antimikrobiálne látky vyvoláva otázku, ako a kedy je stanovenie citlivosti na antibiotiká opodstatnené. Náklady na toto testovanie a čas potrebný na získanie konečného výsledku ešte viac zvyšujú dôležitosť tohto problému. Je jasné, že počiatočná liečba anaeróbnych a zmiešaných infekcií by mala byť empirická. Vychádza zo špecifického charakteru infekcií a určitého spektra bakteriálnej mikroflóry pri danej infekcii. Je potrebné vziať do úvahy patofyziologický stav a predchádzajúce použitie antimikrobiálnych látok, ktoré môžu mať modifikovanú normálnu a léziovú mikroflóru, ako aj výsledky Gramovho farbenia. Ďalším krokom by mala byť včasná identifikácia dominantnej mikroflóry. Informácie o spektre špecifickej antibakteriálnej citlivosti dominantnej mikroflóry. Informácie o spektre druhovej antibakteriálnej citlivosti dominantnej mikroflóry nám umožnia posúdiť primeranosť pôvodne zvoleného liečebného režimu. V liečbe pri nepriaznivom priebehu infekcie je potrebné využiť stanovenie citlivosti čistej kultúry na antibiotiká. V roku 1988 ad hoc pracovná skupina pre anaeróby preskúmala odporúčania a indikácie na testovanie antimikrobiálnej citlivosti u anaeróbov.

Stanovenie citlivosti anaeróbov sa odporúča v týchto prípadoch: a) je potrebné zistiť zmeny v citlivosti anaeróbov na určité liečivá; b) potreba určiť spektrum účinnosti nových liekov; c) v prípadoch zabezpečenia bakteriologického sledovania jednotlivého pacienta. Okrem toho určité klinické situácie môžu tiež diktovať potrebu jeho implementácie: 1) v prípade neúspešne zvoleného počiatočného antimikrobiálneho režimu a pretrvávania infekcie; 2) keď výber účinného antimikrobiálneho lieku hrá kľúčovú úlohu vo výsledku ochorenia; .3), keď je výber lieku v tomto konkrétnom prípade ťažký.

Treba mať na pamäti, že z klinického hľadiska sú tu ďalšie body: a) veľký klinický problém je zvyšovanie rezistencie anaeróbnych baktérií na antimikrobiálne lieky; b) medzi klinickými lekármi existuje nezhoda o klinickej účinnosti určitých liekov proti anaeróbnym infekciám; c) existujú nezrovnalosti vo výsledkoch citlivosti mikroorganizmov na liečivá in vitro a ich účinnosti in vivo; r) Interpretácia výsledkov, ktorá je prijateľná pre aeróby, sa nemusí vždy vzťahovať na anaeróby. Pozorovanie citlivosti/rezistencie 1200 bakteriálnych kmeňov izolovaných z rôznych biotopov ukázalo, že značná časť z nich je vysoko odolná voči najpoužívanejším liekom (tabuľka 11).

Tabuľka 11. Odolnosť anaeróbnych baktérií voči

bežne používané antibiotiká

baktérie	Antibiotiká		Percento rezistentných foriem
Peptostreptokok	Penicilín Erytromycín Klindamycín
Clostridium perfringens	Penicilín Cefoxitín Metronidazol Erytromycín Klindamycín
Bacteroides fragilis	Cefoxitín Metronidazol Erytromycín Klindamycín
Veilonella	Penicilín Metronidazol Erytromycín

Početné štúdie zároveň stanovili minimálne inhibičné koncentrácie najbežnejších liekov, ktoré sú primerané na liečbu anaeróbnych infekcií (tabuľka 12).

Tabuľka 12 Minimálne inhibičné koncentrácie

antibiotiká pre anaeróbne mikroorganizmy

Minimálna inhibičná koncentrácia (MIC) je najnižšia koncentrácia antibiotika, ktorá úplne inhibuje rast mikroorganizmov. Veľmi dôležitým problémom je štandardizácia a kontrola kvality určovania citlivosti mikroorganizmov na antibiotiká (použité testy, ich štandardizácia, príprava médií, činidiel, školenie personálu vykonávajúceho tento test, použitie referenčných kultúr: B. fragilis-ATCC 25285; B. thetaiotaomicron - ATCC 29741; C. perfringens-ATCC 13124; E. lentum-ATCC 43055).

V pôrodníctve a gynekológii sa na liečbu anaeróbnych infekcií používa penicilín, niektoré cefalosporíny 3-4 generácie, linkomycín, chloramfenikol. Najúčinnejšími antianaeróbnymi liekmi sú však zástupcovia skupiny 5-nitroimidazolov - metronidazol, tinidazol, ornidazol a klindamycín. Účinnosť liečby samotným metronidazolom je v závislosti od ochorenia 76 – 87 % a tinidazolom 78 – 91 %. Kombinácia imidazolov s aminoglykozidmi, cefalosporínmi 1. – 2. generácie zvyšuje úspešnosť liečby až na 90 – 95 %. Významnú úlohu v liečbe anaeróbnych infekcií má klindamycín. Kombinácia klindamycínu s gentamicínom je referenčnou metódou liečby hnisavých zápalových ochorení ženských pohlavných orgánov, najmä pri zmiešaných infekciách.

6. Korekcia črevnej mikroflóry

Počas minulého storočia bola normálna ľudská črevná mikroflóra predmetom aktívneho výskumu. Početné štúdie preukázali, že pôvodná mikroflóra gastrointestinálneho traktu zohráva významnú úlohu pri zabezpečovaní zdravia hostiteľského organizmu, zohráva dôležitú úlohu pri dozrievaní a udržiavaní funkcie imunitného systému, ako aj pri zabezpečovaní mnohých metabolické procesy. Východiskom pre rozvoj dysbiotických prejavov v čreve je potlačenie autochtónnej anaeróbnej mikroflóry – bifidobaktérií a laktobacilov, ako aj stimulácia reprodukcie oportúnnej mikroflóry – enterobaktérie, stafylokoky, streptokoky, klostrídie, kandidy. I. I. Mechnikov formuloval hlavné vedecké ustanovenia týkajúce sa úlohy pôvodnej črevnej mikroflóry, jej ekológie a predložil myšlienku nahradenia škodlivej mikroflóry prospešnou, aby sa znížila intoxikácia tela a predĺžil sa ľudský život. Myšlienka I. I. Mechnikova sa ďalej rozvíjala vo vývoji množstva bakteriálnych prípravkov používaných na korekciu alebo „normalizáciu“ ľudskej mikroflóry. Nazývajú sa „eubiotiká“, alebo „probiotiká“, a obsahujú živé resp

sušené baktérie rodov Bifidobacterium a Lactobacillus. Preukázala sa imunomodulačná aktivita mnohých eubiotík (zaznamenáva sa stimulácia tvorby protilátok, aktivita peritoneálnych makrofágov). Je tiež dôležité, že kmene eubiotických baktérií majú chromozomálnu rezistenciu voči antibiotikám a ich kombinované podávanie zvyšuje mieru prežitia zvierat. Najrozšírenejšie fermentované mliečne formy laktobakterínu a bifidumbakterínu (4).

7. Záver

Anaeróbna infekcia je jedným z neriešených problémov modernej medicíny (najmä chirurgia, gynekológia, terapia, stomatológia). Diagnostické ťažkosti, nesprávne hodnotenie klinických údajov, chyby v liečbe, antibiotickej terapii a pod. vedú k vysokej úmrtnosti pacientov s anaeróbnymi a zmiešanými infekciami. To všetko poukazuje na potrebu rýchlo odstrániť existujúci nedostatok vedomostí v tejto oblasti bakteriológie a významné nedostatky v diagnostike a terapii.

anaeróbne organizmy

Aeróbne a anaeróbne baktérie sú predbežne identifikované v tekutom živnom médiu pomocou gradientu koncentrácie O2:
1. Obligátne aeróbne baktérie (náročné na kyslík). väčšinou zhromaždené v hornej časti trubice, aby absorbovali maximálne množstvo kyslíka. (Výnimka: mykobaktérie - rast filmu na povrchu v dôsledku voskovo-lipidovej membrány.)
2. Obligátne anaeróbne baktérie sa zhromažďujú na dne, aby sa vyhli kyslíku (alebo nerástli).
3. Voliteľné baktérie sa zhromažďujú hlavne v hornej časti (čo je výhodnejšie ako glykolýza), ale možno ich nájsť v celom médiu, pretože nezávisia od O 2 .
4. Mikroaerofily sa zhromažďujú v hornej časti trubice, ale ich optimum je nízka koncentrácia kyslíka.
5. Aerotolerantný anaeróby nereagujú na koncentrácie kyslíka a sú rovnomerne rozložené v skúmavke.

Anaeróby- organizmy, ktoré prijímajú energiu v neprítomnosti prístupu kyslíka fosforyláciou substrátu, môžu byť konečné produkty neúplnej oxidácie substrátu oxidované na produkciu väčšieho množstva energie vo forme ATP v prítomnosti konečného akceptora protónov organizmami, ktoré vykonávajú oxidáciu fosforylácia.

Anaeróby predstavujú rozsiahlu skupinu organizmov na mikro aj makro úrovni:

• anaeróbne mikroorganizmy- rozsiahla skupina prokaryotov a niektorých prvokov.
• makroorganizmy - huby, riasy, rastliny a niektoré živočíchy (trieda foraminifera, väčšina helmintov (trieda motolíc, pásomnice, škrkavky (napríklad ascaris)).

Okrem toho hrá anaeróbna oxidácia glukózy dôležitú úlohu v práci priečne pruhovaných svalov zvierat a ľudí (najmä v stave tkanivovej hypoxie).

Klasifikácia anaeróbov

Podľa klasifikácie stanovenej v mikrobiológii existujú:

• Fakultatívne anaeróby
• Kapneistické anaeróby a mikroaerofily
• Aerotolerantné anaeróby
• Stredne prísni anaeróbi
• povinných anaeróbov

Ak je organizmus schopný prejsť z jednej metabolickej dráhy na druhú (napríklad z anaeróbneho dýchania na aeróbne dýchanie a naopak), potom sa podmienečne označuje ako fakultatívne anaeróby .

Do roku 1991 sa trieda rozlišovala v mikrobiológii kapneistické anaeróby vyžadujúce nízku koncentráciu kyslíka a zvýšenú koncentráciu oxidu uhličitého (typ hovädzieho dobytka Brucella - B. abortus)

Stredne prísny anaeróbny organizmus prežíva v prostredí s molekulárnym O 2, ale nerozmnožuje sa. Mikroaerofily sú schopné prežiť a množiť sa v prostredí s nízkym parciálnym tlakom O 2 .

Ak organizmus nie je schopný „prepnúť“ z anaeróbneho na aeróbne dýchanie, ale v prítomnosti molekulárneho kyslíka neumiera, potom patrí do skupiny aerotolerantné anaeróby. Napríklad kyselina mliečna a mnohé maslové baktérie

povinný anaeróby v prítomnosti molekulárneho kyslíka O 2 zomierajú - napríklad zástupcovia rodu baktérie a archaea: Bacteroides, Fusobacterium, Butyrivibrio, metanobaktérie). Takéto anaeróby neustále žijú v prostredí bez kyslíka. Obligátne anaeróby zahŕňajú niektoré baktérie, kvasinky, bičíkovce a nálevníky.

Toxicita kyslíka a jeho formy pre anaeróbne organizmy

Prostredie bohaté na kyslík je agresívne voči organickým formám života. Je to spôsobené tvorbou reaktívnych foriem kyslíka v priebehu života alebo vplyvom rôznych foriem ionizujúceho žiarenia, ktoré sú oveľa toxickejšie ako molekulárny kyslík O 2 . Faktor, ktorý určuje životaschopnosť organizmu v kyslíkovom prostredí, je prítomnosť funkčného antioxidačného systému schopného eliminovať: superoxidový anión (O 2 -), peroxid vodíka (H 2 O 2), singletový kyslík (O .) a aj molekulárny kyslík ( O 2) z vnútorného prostredia tela. Najčastejšie je takáto ochrana poskytovaná jedným alebo viacerými enzýmami:

• superoxiddismutáza eliminujúca superoxidový anión (O 2 -) bez energetického prínosu pre telo
• kataláza, eliminujúca peroxid vodíka (H 2 O 2) bez energetického prínosu pre telo
• cytochróm- enzým zodpovedný za prenos elektrónov z NAD H na O 2. Tento proces poskytuje telu významný energetický prínos.

Aeróbne organizmy obsahujú najčastejšie tri cytochrómy, fakultatívne anaeróby - jeden alebo dva, obligátne anaeróby cytochrómy neobsahujú.

Anaeróbne mikroorganizmy môžu aktívne ovplyvňovať prostredie, čím vytvárajú vhodný redoxný potenciál prostredia (napr. Cl.perfringens). Niektoré naočkované kultúry anaeróbnych mikroorganizmov skôr, ako sa začnú množiť, znížia pH 2 0 z hodnoty na , pričom sa chránia redukčnou bariérou, iné – aerotolerantné – produkujú počas svojej životnej činnosti peroxid vodíka, čím zvyšujú pH 2 0.

Glykolýza je zároveň charakteristická iba pre anaeróby, ktoré sa v závislosti od konečných reakčných produktov delia na niekoľko typov fermentácie:

• mliečna fermentácia Lactobacillus ,Streptococcus , Bifidobacterium, ako aj niektoré tkanivá mnohobunkových živočíchov a ľudí.
• alkoholová fermentácia - sacharomycetes, candida (organizmy z ríše húb)
• kyselina mravčia - rodina enterobaktérií
• maslová – niektoré druhy klostrídií
• kyselina propiónová - propionobaktérie (napr. Propionibacterium acnes)
• fermentácia s uvoľňovaním molekulárneho vodíka - niektoré druhy Clostridium, Stickland fermentácia
• metánová fermentácia - napr. metanobaktérie

V dôsledku rozkladu glukózy sa spotrebujú 2 molekuly a syntetizujú sa 4 molekuly ATP. Celkový výťažok ATP je teda 2 molekuly ATP a 2 molekuly NAD·H2. Pyruvát získaný počas reakcie bunka využíva rôznymi spôsobmi v závislosti od typu fermentácie, ktorá nasleduje.

Antagonizmus fermentácie a rozkladu

V procese evolúcie sa vytvoril a upevnil biologický antagonizmus fermentačnej a hnilobnej mikroflóry:

Rozklad sacharidov mikroorganizmami je sprevádzaný výrazným úbytkom prostredia, zatiaľ čo rozklad bielkovín a aminokyselín je sprevádzaný nárastom (alkalinizáciou). Adaptácia každého z organizmov na určitú reakciu prostredia zohráva v prírode a ľudskom živote dôležitú úlohu, napríklad vďaka fermentačným procesom sa predchádza hnilobe siláže, fermentovanej zeleniny, mliečnych výrobkov.

Pestovanie anaeróbnych organizmov

Schématická izolácia čistej kultúry anaeróbov

Kultivácia anaeróbnych organizmov je predovšetkým úlohou mikrobiológie.

Na pestovanie anaeróbov sa používajú špeciálne metódy, ktorých podstatou je odstrániť vzduch alebo ho nahradiť špecializovanou zmesou plynov (alebo inertnými plynmi) v utesnených termostatoch. - anaerostaty .

Ďalším spôsobom pestovania anaeróbov (najčastejšie mikroorganizmov) na živných pôdach je pridávanie redukčných látok (glukóza, sodná soľ kyseliny mravčej a pod.), ktoré znižujú redoxný potenciál.

Bežné rastové médiá pre anaeróbne organizmy

Pre všeobecné prostredie Wilson - Blair základom je agar-agar s prídavkom glukózy, siričitanu sodného a chloridu železnatého. Klostrídie tvoria čierne kolónie na tomto médiu redukciou siričitanu na sulfidový anión, ktorý sa spája s katiónmi železa (II) za vzniku čiernej soli. Na tomto médiu sa v hĺbke agarového stĺpca spravidla objavujú čierne kolónie.

streda Kitta - Tarozzi pozostáva z mäsovo-peptónového vývaru, 0,5% glukózy a kúskov pečene alebo mletého mäsa na absorbovanie kyslíka z prostredia. Pred výsevom sa médium zahrieva vo vriacom vodnom kúpeli počas 20-30 minút, aby sa z média odstránil vzduch. Po zasiatí sa živné médium ihneď naplní vrstvou parafínu alebo parafínového oleja, aby sa izolovalo od prístupu kyslíka.

Všeobecné kultivačné metódy pre anaeróbne organizmy

Gaspack- systém chemicky zabezpečuje stálosť zmesi plynov prijateľnú pre rast väčšiny anaeróbnych mikroorganizmov. V uzavretej nádobe voda reaguje s borohydridom sodným a tabletami hydrogénuhličitanu sodného za vzniku vodíka a oxidu uhličitého. Vodík potom reaguje s kyslíkom plynnej zmesi na paládiovom katalyzátore za vzniku vody, ktorá už znovu reaguje s hydrolýzou borohydridu.

Túto metódu navrhli Brewer a Olgaer v roku 1965. Vývojári predstavili jednorazové vrecko generujúce vodík, ktoré bolo neskôr vylepšené na vrecúška generujúce oxid uhličitý s vnútorným katalyzátorom.

Zeisslerova metóda používa sa na izoláciu čistých kultúr spórotvorných anaeróbov. Za týmto účelom naočkujte médium Kitt-Tarozzi, zohrejte ho 20 minút na 80 ° C (na zničenie vegetatívnej formy), naplňte médium vazelínovým olejom a inkubujte 24 hodín v termostate. Potom sa uskutoční naočkovanie na cukrovo-krvný agar, aby sa získali čisté kultúry. Po 24-hodinovej kultivácii sa skúmajú kolónie záujmu - subkultivujú sa na Kitt-Tarozziho médiu (s následnou kontrolou čistoty izolovanej kultúry).

Fortnerova metóda

Fortnerova metóda- očkovanie sa robí na Petriho miske so zhrubnutou vrstvou média, rozdelenej na polovicu úzkou drážkou vyrezanou v agare. Jedna polovica je naočkovaná kultúrou aeróbnych baktérií, druhá polovica je naočkovaná anaeróbnymi baktériami. Okraje pohára sú naplnené parafínom a inkubované v termostate. Spočiatku sa pozoruje rast aeróbnej mikroflóry a potom (po absorpcii kyslíka) sa rast aeróbnej mikroflóry náhle zastaví a začne rast anaeróbnej mikroflóry.

Weinbergova metóda používané na získanie čistých kultúr obligátnych anaeróbov. Kultúry pestované na médiu Kitta-Tarozzi sa prenesú do cukrového bujónu. Potom sa pomocou jednorazovej Pasteurovej pipety materiál prenesie do úzkych skúmaviek (skúmavky Vignal) s cukrovým mäsovo-peptónovým agarom, pričom sa pipeta ponorí na dno skúmavky. Naočkované skúmavky sa rýchlo ochladzujú, čo umožňuje fixáciu bakteriálneho materiálu v hrúbke vytvrdnutého agaru. Skúmavky sa inkubujú v termostate a potom sa skúmajú rastúce kolónie. Keď sa nájde záujmová kolónia, urobí sa na jej mieste rez, materiál sa rýchlo odoberie a naočkuje na médium Kitta-Tarozzi (s následnou kontrolou čistoty izolovanej kultúry).

Peretzova metóda

Peretzova metóda- do roztopeného a vychladnutého cukrového agaru sa vloží kultúra baktérií a naleje sa pod sklo umiestnené na korkových tyčinkách (alebo úlomkoch zápaliek) v Petriho miske. Metóda je najmenej spoľahlivá zo všetkých, ale jej použitie je celkom jednoduché.

Diferenciálne - diagnostické živné pôdy

• prostredia gissa("pestrý riadok")
• streda Ressel(Russell)
• streda Ploskireva alebo baktoagar "Zh"
• Bizmutový sulfitový agar

Syčanie médií: Do 1% peptónovej vody pridajte 0,5% roztok určitého uhľohydrátu (glukóza, laktóza, maltóza, manitol, sacharóza atď.) a Andredeho acidobázický indikátor, nalejte do skúmaviek, do ktorých sa umiestni plavák na zachytávanie plynov. produkty vznikajúce pri rozklade uhľovodíkov.

Resselova streda(Russell) sa používa na štúdium biochemických vlastností enterobaktérií (Shigella, Salmonella). Obsahuje výživný agar-agar, laktózu, glukózu a indikátor (brómtymolovú modrú). Farba média je trávovo zelená. Zvyčajne sa pripravuje v 5 ml skúmavkách so skoseným povrchom. Výsev sa vykonáva vstrekovaním do hĺbky stĺpa a ťahom po skosenej ploche.

Streda Ploskirev(Bactoagar Zh) je diferenciálne diagnostické a selektívne médium, pretože inhibuje rast mnohých mikroorganizmov a podporuje rast patogénnych baktérií (pôvodcov týfusu, paratýfusu, dyzentérie). Baktérie negatívne na laktózu tvoria na tomto médiu bezfarebné kolónie, zatiaľ čo baktérie pozitívne na laktózu tvoria červené kolónie. Medium obsahuje agar, laktózu, brilantnú zeleň, žlčové soli, minerálne soli, indikátor (neutrálna červená).

Bizmutový sulfitový agar Je určený na izoláciu salmonely v jej čistej forme z infikovaného materiálu. Obsahuje tryptický digest, glukózu, rastové faktory salmonely, brilantnú zeleň a agar. Rozdielne vlastnosti média sú založené na schopnosti Salmonella produkovať sírovodík, na ich odolnosti voči prítomnosti sulfidu, brilantnej zelene a citrátu bizmutitého. Kolónie sú označené čiernou farbou sulfidu bizmutu (technika je podobná médiu Wilson - Blair).

Metabolizmus anaeróbnych organizmov

Metabolizmus anaeróbnych organizmov má niekoľko odlišných podskupín:

Anaeróbny energetický metabolizmus v tkanivách človek a zvierat

Anaeróbna a aeróbna produkcia energie v ľudských tkanivách

Niektoré tkanivá zvierat a ľudí sa vyznačujú zvýšenou odolnosťou voči hypoxii (najmä svalové tkanivo). Za normálnych podmienok prebieha syntéza ATP aeróbne a pri intenzívnej svalovej aktivite, kedy je sťažený prísun kyslíka do svalov, v stave hypoxie, ako aj pri zápalových reakciách v tkanivách dominujú anaeróbne mechanizmy regenerácie ATP. V kostrových svaloch boli identifikované 3 typy anaeróbnych a len jedna aeróbna dráha regenerácie ATP.

3 typy anaeróbnej dráhy syntézy ATP

Anaeróbne zahŕňajú:

• Mechanizmus kreatínfosfatázy (fosfogénny alebo alaktátový) - refosforylácia medzi kreatínfosfátom a ADP
• Myokináza - syntéza (inak resyntéza) ATP v reakcii transfosforylácie 2 molekúl ADP (adenylátcyklázy)
• Glykolytické – anaeróbne odbúravanie zásob glukózy alebo glykogénu v krvi, končiace tvorbou